甘薯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的生物信息学鉴定和表达分析

Bioinformatic Identification and Expression Analysis of 4CL Genes in Ipomoea batatas

徐靖 ¹林延慧 ¹王效宁 ¹韩义胜 ¹唐力琼 ¹王新华 ¹朱红林¹

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作者信息

1. 海南省农业科学院粮食作物研究所,海南省农作物遗传育种重点实验室,农业部作物基因资源与种质创制海南科学观测实验站,海口571100
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摘要

4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)在苯丙烷类代谢途径中具有重要调控作用.该研究利用转录组数据在甘薯品种QS48中鉴定了11个4CL基因,并将这些基因命名为Ib4CL1～Ib4CL11.序列比对和功能域分析发现,11个Ib4CL蛋白均具有典型的4CL结构特征,包含保守的Box Ⅰ和BoxⅡ的结构域.进化和保守基序分析显示,Ib4CL1和Ib4CL2属于Ⅰ类4CL,Ib4CL3属于Ⅱ类4CL,而Ib4CL4～Ib4CL11属于4CL类似蛋白.转录组数据和荧光定量PCR分析显示,Ib4CL3和Ib4CL10在甘薯QS48的叶中转录表达水平显著高于茎和块根,与绿原酸的积累呈正相关关系;Ib4CL4和Ib4CL8在嫩叶中表达较高,与花青素的积累密切相关.研究结果为进一步揭示甘薯4CL基因在苯丙烷类代谢途径中的功能奠定了基础.

关键词

甘薯/4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)/绿原酸/花青素/表达分析

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基金项目

海南省科研院所技术开发专项(kYYS2018-03)

出版年

2020

西北植物学报

西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：1.031

ISSN：1000-4025

被引量4

参考文献量5

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