西北植物学报2020,Vol.40Issue(6) :937-948.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2020.06.0937

茶树脯氨酸转运蛋白基因鉴定及表达分析

Identification and Expression Profiling Analysis of CsProTs Gene Family in Tea Plant

代洪苇 周盈盈 郑姝婷 童华荣 袁连玉
西北植物学报2020,Vol.40Issue(6) :937-948.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2020.06.0937

茶树脯氨酸转运蛋白基因鉴定及表达分析

Identification and Expression Profiling Analysis of CsProTs Gene Family in Tea Plant

代洪苇 1周盈盈 1郑姝婷 1童华荣 2袁连玉2
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作者信息

  • 1. 西南大学食品科学学院,重庆400715;西南大学食品科学与工程国家级实验教学示范中心,重庆400715
  • 2. 西南大学食品科学学院,重庆400715
  • 折叠

摘要

脯氨酸转运蛋白在植物体内脯氨酸的分配及响应多种非生物逆境胁迫过程中发挥着重要作用.为明确茶树体内脯氨酸转运蛋白家族情况,该研究从全基因组水平鉴定获得茶树脯氨酸转运蛋白家族成员,进行了系统进化关系、蛋白结构、基因表达特异性等分析.结果 表明:(1)茶树中有6个脯氨酸转运蛋白基因,长度为1 326~1 725 bp之间,编码氨基酸数目在441~574 aa之间,蛋白质分子质量在48.5~63.0 kD之间,等电点为8.51~9.41,大部分为碱性蛋白,其结构中含有大量的α-螺旋和自由卷曲,少量的延长链和β-转角结构.(2)亚细胞定位分析结果显示,茶树CsProT1、CsProT2、CsProT4、CsProT5和CsProT6蛋白定位于细胞膜,CsProT3蛋白则定位于高尔基体.(3)CsProTs蛋白中含9~11个典型的跨膜结构域,其三级结构与保守基序特征均与拟南芥高度相似,具有高度的保守性,不同成员间氨基酸序列相似性达40.14.(4)基因表达特异性分析显示,CsProT1,Cs ProT2和CsProT3基因在各个组织部位的表达量均较高,Cs Pro T4、Cs Pro T5和Cs Pro T6表达量均较低,且CsProT1基因的表达量最高;除CsProTs基因外,CsProTs蛋白家族的基因均受到NaCl、干旱及冷胁迫的诱导表达.(5)蛋白相互作用分析结果显示,CsProTs蛋白可与脯氨酸氧化酶ERD5,脯氨酸生物合成限速酶P5CS1、P5CS2和δ-吡咯啉-5-羧酸脱氢酶ALDH12A1等脯氨酸合成,转运及降解有关的蛋白相互作用,共同调控茶树体内脯氨酸的含量.研究认为,茶树6个CsProTs蛋白可共同参与茶树体内脯氨酸的转运平衡及对多种非生物逆境胁迫响应的过程.

关键词

茶树/CsProTs/脯氨酸/全基因组鉴定/表达分析

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基金项目

国家自然科学基金(31400583)

重庆市基础与前沿研究计划一般项目(cstc2019jcyj-msxmX0241)

中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2018C069)

出版年

2020
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量5
参考文献量7
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