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马铃薯StCML基因家族鉴定及表达分析

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类钙调蛋白(calmodulin-like protein,CML)是植物中一种重要的Ca2+结合蛋白,在植物生长发育和胁迫响应过程中起着重要的作用.该研究通过生物信息学方法在马铃薯基因组中鉴定了 StCML基因家族成员,并对它们的表达模式及胁迫响应进行了分析,为深入解析马铃薯StCML基因家族成员在生长发育和胁迫响应中的作用机制奠定理论基础.结果显示:(1)在马铃薯基因组中共鉴定到80个StCML基因,它们均具有EF-hand结构;根据系统进化树拓扑结构可分为5个亚家族,在1～5亚家族中分别含有18、12、14、12、和24个基因,大部分基因具有较为保守的基因结构和基序.(2)RNA-Seq数据分析发现,StCML基因主要在马铃薯的花、叶柄、芽、雄蕊、匍匐茎和块茎中有特异表达,并且主要对盐、热、干旱和赤霉素处理有响应.(3)qRT-PCR分析发现,在低温胁迫下StCML 13、StCML21和StCML53表达上调;在高温胁迫下StCML11、StCML21和StCML39表达上调;盐胁迫下StCML21和StCML60表达上调;青枯菌处理下StCML53表达上调,StCML8、StCML 13、StCML 21和StC-ML 60表达下调.研究表明,StCML基因对多种胁迫均有响应.
Genome-wide Identification and Expression Analysis of StCML Gene Family in Solanum tuberosum L.

张满仓、张超、赵朋、陈越、陈勤、卢海彬

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西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨陵712100

陕西省土地工程建设集团有限责任公司,西安710753

西北农林科技大学食品科学与工程学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨陵712100

马铃薯 类钙调蛋白 基因家族 胁迫

陕西省自然科学基础研究计划宁夏农林科学院对外科技合作项目

2020JM-160DW-X-2018012

2021

10.7606/j.issn.1000-4025.2021.04.0565

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2021.41(4)
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