西北植物学报2021,Vol.41Issue(6) :962-970.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2021.06.0962

大麦染色体特异IT分子标记的筛选

Screening IT (Intron Targeting) Molecular Markers Specific for Individual Chromosomes of Barley

李红斌 刘志鹏 徐涛 肖进 王秀娥 王海燕
西北植物学报2021,Vol.41Issue(6) :962-970.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2021.06.0962

大麦染色体特异IT分子标记的筛选

Screening IT (Intron Targeting) Molecular Markers Specific for Individual Chromosomes of Barley

李红斌 1刘志鹏 1徐涛 1肖进 1王秀娥 1王海燕1
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作者信息

  • 1. 作物遗传与种质创新国家重点实验室/JCIC-MCP,南京农业大学农学院,南京210095
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摘要

为了筛选高密度且均匀分布于大麦各染色体的分子标记,该研究利用前期开发的2267个IT(intron targe-ting)标记,在'中国春'、栽培大麦(Golden promise)和普通小麦(中国春)-栽培大麦(Betzes)的6个二体异附加系中进行扩增.结果 发现:有534个标记可作为大麦染色体特异的IT分子标记,分别分布在大麦的1H(96个)、2H(84个)、3H(60个)、4H(105个)、5H(59个)、6H(80个)和7H(50个)染色体.进一步利用小麦族多基因组学网站和大麦参考基因组序列进行比对,结果发现,除了标记CINAU800、CINAU1734、CINAU1796、CINAU1736和CINAU1691之外,其余的标记对应的原始基因序列都能比对到大麦对应的同源群的参考基因组中.研究表明,该研究筛选到了534个大麦染色体特异的IT分子标记,多态率为23.56%,略高于其他大麦分子标记;且这些大麦各染色体特异的IT分子标记可用于追踪大麦的特定染色体.

关键词

大麦/分子标记/IT(intron/targeting)标记

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基金项目

出版年

2021
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
参考文献量9
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