摘要
从实验室前期对中国南瓜雌花败育转录组测序结果推测,CmNPR1基因可能在南瓜花发育过程中发挥重要功能.该研究以中国南瓜自交系'3-1'为试验材料,采用同源克隆方法获得中国南瓜CmNPR1基因CDS序列,通过生物信息学、基因表达以及亚细胞定位分析对该基因进行初步研究,为进一步研究CmNPR1基因在南瓜花发育中的功能和作用机制奠定基础.结果表明:(1)中国南瓜CmNPR1基因CDS全长1442 bp,编码480个氨基酸;蛋白序列包含有一个BTB/POZ和一个锚蛋白重复序列(Ank)保守结构域;该蛋白无信号肽和跨膜结构;多序列比对分析结果显示,CmNPR1氨基酸序列与美洲南瓜的亲缘关系最近,为96.05％,其次是印度南瓜,为95.63％.(2)CmNPR1基因在所取样品中花纵径0.5 cm时期表达量最高,且在花不同结构中柱头的表达量最高.(3)通过拟南芥原生质体亚细胞定位分析发现,该蛋白定位于细胞质和细胞核.
基金项目
国家自然科学基金(U2004161)
国家自然科学基金(31401876)
河南省重点研发与推广专项(212102110128)
河南省重大公益专项(201300111300)
河南科技学院百农英才项目(BNYC2018-2-24)
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