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中国南瓜CmNPR1基因的克隆和表达分析

Cloning and Expression Analysis of CmNPR1 Gene in Cucurbita moschata

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从实验室前期对中国南瓜雌花败育转录组测序结果推测,CmNPR1基因可能在南瓜花发育过程中发挥重要功能.该研究以中国南瓜自交系'3-1'为试验材料,采用同源克隆方法获得中国南瓜CmNPR1基因CDS序列,通过生物信息学、基因表达以及亚细胞定位分析对该基因进行初步研究,为进一步研究CmNPR1基因在南瓜花发育中的功能和作用机制奠定基础.结果表明:(1)中国南瓜CmNPR1基因CDS全长1442 bp,编码480个氨基酸;蛋白序列包含有一个BTB/POZ和一个锚蛋白重复序列(Ank)保守结构域;该蛋白无信号肽和跨膜结构;多序列比对分析结果显示,CmNPR1氨基酸序列与美洲南瓜的亲缘关系最近,为96.05％,其次是印度南瓜,为95.63％.(2)CmNPR1基因在所取样品中花纵径0.5 cm时期表达量最高,且在花不同结构中柱头的表达量最高.(3)通过拟南芥原生质体亚细胞定位分析发现,该蛋白定位于细胞质和细胞核.

陈培雯、张立、陈学进、李新峥、李庆飞

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河南科技学院园艺园林学院,河南新乡453003

河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心,河南新乡 453003

中国南瓜 CmNPR1 基因克隆 生物信息学分析 亚细胞定位

国家自然科学基金国家自然科学基金河南省重点研发与推广专项河南省重大公益专项河南科技学院百农英才项目

U200416131401876212102110128201300111300BNYC2018-2-24

2021

10.7606/j.issn.1000-4025.2021.12.2038

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2021.(12)
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