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茶树SBP-box转录因子的比较基因组学与遗传分析

Comparative Genomics and Genetic Analysis of SBP-box Transcription Factors in Camellia sinensis

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SQUAMOSA启动子结合蛋白(SBP-box)是植物特异性转录因子,在植物生长发育中发挥重要作用.该研究利用生物信息学分析方法,对不同'铁观音'、'黄棪'、'舒茶早'和'龙井43'茶树基因组的SBP基因进行鉴定和比较,通过qRT-PCR技术分析CsTGY_SBP家族成员在不同茶树品种中的表达模式,为探究SBP基因在茶树杂种和亲本上的遗传规律提供参考.结果显示:(1)在茶树品种'铁观音'、'黄棪'、'舒茶早'和'龙井43'基因组中分别鉴定出21个、25个、24个和23个SBP家族基因.(2)系统进化树将其分为8个亚家族,共线性分析发现茶树和拟南芥、葡萄的SBP基因共线性关系与水稻相比更强,同物种内发现'铁观音'与'黄棪'的共线性关系更显著.(3)qRT-PCR结果表明,CsTGY_SBP5、CsTGY_SBP9和CsTGY_SBP14在F1'金观音'中呈中亲表达的模式;大部分CsTGY_SBPs基因在F1'黄观音'呈低于双亲表达模式,CsTGY_SBP5和CsTGY_SBP8在F1'金牡丹'中显著高于亲本;CsTGY_SBP5、CsTGY_SBP7、CsTGY_SBP12、CsTGY_SBP16和CsTGY_SBP18在F1'紫玫瑰'中的表达量显著高于亲本,呈超高亲表达的模式;CsTGY_SBPs基因在F1'紫牡丹'中整体表达趋于亲本铁观音,在F1'瑞香'中整体呈现低于亲本'黄棪'的表达模式.研究表明,CsTGY_SBP5在F1'金牡丹'和F1'紫玫瑰'中的表达均显著高于亲本,推测CsTGY_SBP5可能是茶树杂种优势的重要调控因子.

谷梦雅、侯炳豪、王鹏杰、高婷、张兴坦、叶乃兴

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福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福州 350002

中国农业科学院 深圳农业基因组研究所,广东深圳518120

茶树 铁观音 黄棪 SBP-box转录因子 比较基因组 遗传分析

福建省011协同创新中心中国乌龙茶产业协同创新中心专项安溪茶叶重大科技创新专项福建农林大学优秀硕士学位论文资助基金

闽教科[2015]75号AX20210011122YS01001

2021

10.7606/j.issn.1000-4025.2021.12.2046

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2021.(12)
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