西北植物学报2022,Vol.42Issue(1) :38-47.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.01.0038

茎瘤芥异戊烯基转移酶家族基因全基因组鉴定及表达分析

Genome-wide Identification and Expression Analysis of Isopentenyl Transferases Genes in Tuber Mustard

蔡兆明 程春红 廖静静 王殿东
西北植物学报2022,Vol.42Issue(1) :38-47.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.01.0038

茎瘤芥异戊烯基转移酶家族基因全基因组鉴定及表达分析

Genome-wide Identification and Expression Analysis of Isopentenyl Transferases Genes in Tuber Mustard

蔡兆明 1程春红 1廖静静 1王殿东1
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作者信息

  • 1. 长江师范学院生命科学与技术学院,重庆408100
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摘要

该研究以茎瘤芥栽培品种'永安小叶'为实验材料,在全基因组水平对茎瘤芥基因组中异戊烯基转移酶(IPT)家族基因成员进行鉴定;通过荧光定量PCR检测各基因在不同组织、盐胁迫和根肿菌胁迫条件下的表达模式.结果 显示:(1)在茎瘤芥基因组中共鉴定到27个IPT家族基因,分布在14条染色体上,它们在系统进化树中可聚类为7个分支.(2)大部分IPT家族基因主要在茎瘤芥的根和茎中表达,在叶片、花和种荚中表达量相对较低.BjuB006281在茎中的表达水平最高,BjuA027211、BjuB010173、BjuB010174和BjuA001839在根中的表达水平较高.(3)大部分的IPT基因表达受盐胁迫抑制,BjuB006281、BjuA036403、BjuB010173、BjuB026254在盐胁迫12~48 h显著下调表达;BjuB022918和BjuB007352则在盐胁迫24~48 h显著下调表达.(4)大部分茎瘤芥IPT基因在12h受到根肿菌侵染的显著诱导,其中BjuB006281、BjuA014415、BjuB022918在侵染后12h的表达水平为0h对照的15倍以上.该研究鉴定出多个响应盐胁迫和根肿菌胁迫的IPT基因,为进一步研究他们的基因功能奠定了基础.

关键词

茎瘤芥/异戊烯基转移酶/盐胁迫/根肿菌/基因家族

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基金项目

国家自然科学基金(31800311)

重庆市科技局项目(cstc2019jcyj-msxmX0285)

重庆市教委项目(KJQN201901406)

长江师范学院青年人才项目(2018QNRC20)

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量6
参考文献量5
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