西北植物学报2022,Vol.42Issue(3) :361-370.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.03.0361

芥蓝SPL基因家族鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of SPL Gene Family in Chinese Kale

曾东琳 唐为玲 曾家晶 Gefu WANG-PRUSKI 赖钟雄 郭容芳
西北植物学报2022,Vol.42Issue(3) :361-370.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.03.0361

芥蓝SPL基因家族鉴定及表达分析

Identification and Expression Analysis of SPL Gene Family in Chinese Kale

曾东琳 1唐为玲 1曾家晶 1Gefu WANG-PRUSKI 2赖钟雄 1郭容芳3
扫码查看

作者信息

  • 1. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002
  • 2. 福建农林大学戴尔豪西大学联合实验室,福州350002
  • 3. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州350002;福建农林大学戴尔豪西大学联合实验室,福州350002
  • 折叠

摘要

SPL存在于所有绿色植物中,在植物生长发育及叶片形成中起着重要的作用.该研究以'改良香菇'芥蓝为材料,采用生物信息学方法,对芥蓝SPL家族(BoSPL)进行全基因组鉴定及分析;采用PCR技术克隆BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2基因,并对芥蓝不同生长时期及不同组织部位进行定量分析,为揭示'改良香菇'芥蓝叶片发育过程的分子机制以及培育芥蓝新品种奠定基础.结果表明:(1)BoSPL家族共有31个成员,编码区蛋白质氨基酸长度在157~1 028 aa之间,BoSPL蛋白质的氨基酸均没有信号肽,属于非分泌蛋白;亚细胞定位预测结果显示,所有的BoSPL家族成员均有定位在细胞核上,少数成员有定位在液泡、叶绿体和细胞质中;BoSPL家族基因包含内含子数量为1~9个,所有成员均包含SBP保守结构域;系统进化分析显示,BoSPL可以分为8个进化群亚组,各群基因数量不等,且BoSPL进化关系与AtSPL相似.(2)成功克隆到BoSPLL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2基因,并成功构建 pCAMBIA1302-35S-BoSPL3-1-GFP、pCAMBIA1302-35S-BoSPL10-2-GFP 和pCAMBIA1302-35S-BoSPL11-2-GFP重组质粒,经根癌农杆菌GV3101介导瞬时转化烟草下表皮细胞,激光共聚焦显微镜检测表明,BBoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2均定位在细胞核中,与预测结果一致.(3)qRT-PCR分析显示,BoSPL3-1、BoSPL10-2和BoSPL11-2在'改良香菇'芥蓝叶片中相对表达量均较高,但3个基因在叶肉中的相对表达量无明显差异,而BoSPL10-2在花状变形叶中却显著高表达,推测其可能与花状变形叶形成相关.

关键词

芥蓝/BoSPL/全基因组鉴定/亚细胞定位

引用本文复制引用

基金项目

国家自然科学基金(31772310)

国家自然科学基金(31401859)

博士后启动经费项目(132300155)

博士后特别项目(第十批)(2017T100464)

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量4
参考文献量6
段落导航相关论文