西北植物学报2022,Vol.42Issue(3) :398-409.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.03.0398

甘草GuWOX基因家族的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of GuWOX Gene Family in Glycyrrhiza uralensis Fisch.

葛甜甜 王楠 高静 张岗 颜永刚 沈雨璇
西北植物学报2022,Vol.42Issue(3) :398-409.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.03.0398

甘草GuWOX基因家族的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of GuWOX Gene Family in Glycyrrhiza uralensis Fisch.

葛甜甜 1王楠 2高静 1张岗 1颜永刚 1沈雨璇1
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作者信息

  • 1. 陕西中医药大学药学院/陕西省中医药管理局秦药研发重点实验室,西安712046
  • 2. 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育),陕西咸阳712083
  • 折叠

摘要

WUSCHEL-related homeobox(WOX)转录因子是植物特有的转录因子,具有调控植物生长发育和非生物胁迫响应的作用.该研究通过生物信息学的方法对GuWOX基因家族进行分析,并利用qRT-PCR方法检测该基因家族在不同组织和非生物胁迫下的表达情况,利用RT-PCR方法克隆得到4 个GuWOX基因.结果显示,(1)GuWOX基因家族共有16个成员,均含有保守的HD,为亲水性不稳定蛋白质;系统进化分析表明,GuWOX基因家族分为3个进化支(远古支、中间支和现代支);启动子序列中包括响应多种逆境和激素的顺式作用元件.(2)qRT-PCR结果显示,在侧根中GuWOX1的表达量最高,在茎中GuWOX15的表达量最高;GuWOX在盐、无磷和GA3处理后不同时间段都有表达;干旱和ABA处理GuWOX15的表达模式相近,且在处理12 h时均上调表达.(3)成功克隆得到GuWOX1、GuWOX5、GuWOX6、GuWOX12基因,其长度分别为557 bp,707 bp,716 bp 和578 bp,分别编码184、237、237和191个氨基酸.该研究结果表明,GuWOX基因参与甘草发育、对逆境胁迫的响应以及植物激素调节,为进一步分析GuWOX基因功能奠定了基础.

关键词

WOX转录因子/生物信息学/实时荧光定量/基因克隆

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基金项目

国家自然科学基金(31600320)

陕西省社会发展科技攻关计划(2018SF-338)

陕西中医药大学学科创新团队项目(2019-QN01)

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量1
参考文献量14
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