西北植物学报2022,Vol.42Issue(5) :751-759.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.05.0751

转录组学对转基因杨树表型变化的代谢调控机制解析

Transcriptomics Analysis of the Metabolic Regulation Mechanism of Phenotypic Changes in Transgenic Poplar

和成成 吴照群 许楠 张秀省 杜鑫 杨海灵
西北植物学报2022,Vol.42Issue(5) :751-759.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.05.0751

转录组学对转基因杨树表型变化的代谢调控机制解析

Transcriptomics Analysis of the Metabolic Regulation Mechanism of Phenotypic Changes in Transgenic Poplar

和成成 1吴照群 1许楠 1张秀省 1杜鑫 1杨海灵1
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作者信息

  • 1. 北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083
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摘要

D型细胞周期蛋白(D-type cyclin)调控着细胞周期G1/S的转变,在植物生长发育过程中发挥重要作用.转基因杨树PtoCYCD2;1(OE-PtoCYCD2;1)植株出现明显的表型变化,株高降低,茎粗变细且叶片发生卷曲.该研究以转基因杨树OE-PtoCYCD2;1为研究材料,通过转录组学测序和生理指标变化并结合植株表型特征分析PtoCYCD2;1在植物生长发育中的功能,为研究木本植物D型细胞周期蛋白功能提供理论基础.结果表明:(1)在OE-PtoCYCD2;1中共鉴定得到1 269个差异表达基因,其中有700个上调表达,569个下调表达.分析发现,有26个属于AP2/ERF转录因子的基因上调表达;有8个下调的差异表达基因富集在木质部合成通路中;在碳代谢通路中共富集27个下调差异表达基因,其中有8个基因富集到卡尔文循环通路中.(2)qRT-PCR实验结果显示,9个差异表达基因的qRT-PCR结果与RNA-seq测定的表达水平变化趋势一致,表明所用RNA-seq结果可靠.(3)生理指标分析发现,与野生型(WT)相比,转基因杨树OE-PtoCYCD2;1的幼叶和成熟叶的总叶绿素含量分别增加57.36%和78.22%;成熟叶的可溶性糖含量下降了 12.72%;幼叶和成熟叶中的木质素含量分别下降了 4.48%和8.03%;幼茎和成熟茎中的木质素含量分别下降了 20.03%和31.63%.研究认为,转基因杨树OE-PtoCYCD2;1通过影响杨树碳代谢和木质素合成过程中相关基因的表达,从而造成转基因植株相应代谢物含量减少,最终导致植株表型改变,总体生物量降低.

关键词

D型细胞周期蛋白/转录组/杨树/生理指标

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基金项目

国家自然科学基金(32071486)

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
参考文献量4
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