西北植物学报2022,Vol.42Issue(5) :770-775.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.05.0770

青花菜细胞质雄性不育相关LncRNAs的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of Cytoplasmic Male Sterile Related LncRNAs in Broccoli

裴徐梨 荆赞革 焦鹏 唐征
西北植物学报2022,Vol.42Issue(5) :770-775.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.05.0770

青花菜细胞质雄性不育相关LncRNAs的鉴定与表达分析

Identification and Expression Analysis of Cytoplasmic Male Sterile Related LncRNAs in Broccoli

裴徐梨 1荆赞革 2焦鹏 1唐征3
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作者信息

  • 1. 昆明学院农学与生命科学学院,昆明650214
  • 2. 昆明学院农学与生命科学学院,昆明650214;温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州325006
  • 3. 温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州325006
  • 折叠

摘要

细胞质雄性不育系的应用可有效提高杂交种质量.该研究利用illumina测序技术鉴定青花菜细胞质雄性不育相关LncRNAs,对其靶基因和表达特征进行分析,并随机选取16个LncRNAs用qRT-PCR技术检测其表达特征,为进一步阐明LncRNA参与青花菜雄性不育发生机制提供新的路径.结果表明:(1)鉴定获得青花菜雄性不育相关LncRNAs共4 326个,其中37个LncRNA在不育系及其保持系中差异表达.(2)差异LncRNAs可预测得到370个cis靶基因,这些靶基因部分为雄性不育相关的转录因子和生物蛋白.(3)XLOC_006651、XLOC_016660、XLOC_003494和XLOC_013121在不育系和保持系花蕾发育早期表达量较高,之后随着花蕾的发育,表达量逐渐下降;XLOC_021769和XLOC_038964呈先降后升的表达模式,且XLOC_038964和XLOC_012613在花蕾不同发育阶段不育系的表达量均高于保持系.(4)16个LncRNA均可在花梗、花萼、花瓣、雄蕊及雌蕊中表达,且XLOC_038964、XLOC_011575、XLOC_013157、XLOC_039677、XLOC_037356、XLOC_034182 和 XLOC_017574呈现出相似的表达模式,在雄蕊和花梗中表达量较低,花萼和花瓣中较高,雌蕊中表达量最高.

关键词

青花菜/细胞质雄性不育/LncRNA/表达分析

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基金项目

云南省科技厅基础研究专项青年项目(2019-1-C-25318000002236)

浙江省自然科学基金(LY18C150006)

云南省应用基础研究计划(2018FH001-044)

浙江省农业(蔬菜)新品种选育重大科技专项(2021C02065-4-2)

温州市科技项目(2019ZX007-2)

浙江省教育厅项目(Y202045786)

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
参考文献量3
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