西北植物学报2022,Vol.42Issue(6) :920-929.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.06.0920

白桦Trihelix家族全基因组鉴定及抗病表达模式分析

Genome Identification and Disease-resistant Expression Pattern Analysis of Trihelix Family of Betula platyphylla

宁小萌 孙晶晶 冯思雨 李天骄 任占辰 李然红
西北植物学报2022,Vol.42Issue(6) :920-929.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.06.0920

白桦Trihelix家族全基因组鉴定及抗病表达模式分析

Genome Identification and Disease-resistant Expression Pattern Analysis of Trihelix Family of Betula platyphylla

宁小萌 1孙晶晶 1冯思雨 1李天骄 1任占辰 1李然红1
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作者信息

  • 1. 牡丹江师范学院生命科学与技术学院,黑龙江牡丹江157012
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摘要

Trihelix家族是植物中特有的一类转录因子家族,在植物生长发育、抗逆反应中具有重要的调控作用.该研究基于白桦基因组数据库,对白桦Trihelix家族基因的表达特性以及抗病功能等进行分析,为Trihelix家族成员在白桦抗病过程中的功能研究奠定基础.结果显示:(1)共筛选到白桦8个Trihelix家族成员(BpTrihelix1~BpTrihelix8),分布在6条染色体上;氨基酸分子量在35 633.96~81 871.27 Da之间,等电点在5.32~8.67之间,均为疏水性氨基酸.(2)组织特异性表达分析表明,8个家族成员在白桦根、茎、叶中均有不同程度的表达,且BpTrihelix3在根、茎、叶中的表达量均最高.(3)病原菌侵染试验结果发现,链格孢霉菌(Alternaria alternata)感染白桦植株叶片48 h和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)感染白桦幼苗根部24 h时,BpTrihelix3、BpTrihelix4和BpTrihelix7均显著上调,其余家族基因表达量无明显变化,说明该家族基因成员中的BpTrihelix3、BpTrihelix4和BpTrihelix7响应了病原菌的感染,推测三者在白桦抗病过程中可能发挥重要作用.

关键词

白桦/Trihelix家族/生物信息学/抗病/表达分析

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基金项目

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量3
参考文献量8
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