西北植物学报2022,Vol.42Issue(6) :943-951.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.06.0943

苹果SRS基因家族的鉴定与功能分析

Identification and Function Analysis of Apple SRS Gene Family

王锦锋
西北植物学报2022,Vol.42Issue(6) :943-951.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.06.0943

苹果SRS基因家族的鉴定与功能分析

Identification and Function Analysis of Apple SRS Gene Family

王锦锋1
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作者信息

  • 1. 陇东学院农林科技学院,甘肃庆阳745000
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摘要

SHI-related sequence(SRS)基因家族通过介导激素变化以调控植物成花及生长发育,并且在适应环境胁迫中起重要调控作用.该研究基于苹果(Malus domestica Borkh.)基因组数据,通过生物信息学手段鉴定苹果SRS基因家族成员,并分析SRS基因家族特点与功能及表达情况.结果表明:(1)苹果MdSRS基因家族共包含11个成员,分别命名为MdSRS1—MdSRS11,不均匀地分布在苹果的9条染色体上.(2)MdSRS蛋白包含229~414个不等的氨基酸残基,等电点分布在6.38~9.36之间;亚细胞定位结果表明,MdSRS蛋白大多分布于细胞膜,在细胞核、叶绿体中也有分布.(3)通过引入拟南芥、水稻、番茄及杨树的SRS基因进行系统发育分析表明,将11个MdSRSs分成5个亚族(A1—A5),在A4中分布最多.(4)顺式作用元件分析表明,11个MdSRSs启动子上游2 000 bp序列分布有激素、环境适应性和逆境诱导等响应元件.(5)荧光定量PCR结果显示,苹果MdSRS基因家族在盐胁迫和干旱胁迫下总体呈下调表达,在ABA胁迫后大多呈上调表达,是具有很大潜力的抗性候选基因,说明SRS家族对ABA调节等非生物胁迫具有调控作用.研究认为,SRS家族的11个成员均参与了调控干旱、盐及ABA胁迫多种逆境的响应,推测在实际苹果生产中对抵御不良环境具有重要作用.

关键词

SRS基因家族/生物学信息分析/表达分析/抗性

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基金项目

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量2
参考文献量7
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