西北植物学报2022,Vol.42Issue(9) :1530-1539.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.09.1530

基于SSR分子标记的中国黄连木遗传多样性分析

Genetic Diversity Analysis of Pistacia chinensis Bunge Based on SSR Markers

任重 白倩 苏淑钗
西北植物学报2022,Vol.42Issue(9) :1530-1539.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2022.09.1530

基于SSR分子标记的中国黄连木遗传多样性分析

Genetic Diversity Analysis of Pistacia chinensis Bunge Based on SSR Markers

任重 1白倩 1苏淑钗1
扫码查看

作者信息

  • 1. 北京林业大学林学院,省部共建森林培育与保护教育部重点实验室,北京100083;北京林业大学,国家能源非粮生物质原料研发中心,北京 100083
  • 折叠

摘要

该研究利用筛选出的7对SSR引物,对中国20个省、市、自治区的210份种质资源进行分子标记试验,分析中国黄连木种质资源遗传多样性、亲缘关系、遗传分化特点并构建DNA分子身份证,为黄连木的资源保护、种质利用提供理论依据,结果表明:(1)7对引物在210份种质中共扩增出158个等位基因位点,平均每对引物的等位基因数为22.571个.(2)基因多样性(GD)变化幅度为0.654~0.913,平均为0.804;期望杂合度(He)变化范围0.257~0.771,平均为0.532;多态信息含量(PIC)变化范围0.639~0.907,平均为0.784.(3)从不同地区黄连木群体的遗传多样性来看,观测杂合度(Ho)介于0.373~0.600之间,平均值为0.520;期望杂合度(He)介于0.632~0.811之间,平均值为0.737;从各群体间遗传分化指数(Fst)来看,黄连木各地区群体间的遗传分化值在0.015~0.099之间,各群体间的遗传分化处于中等以下水平.(4)分子方差分析(AMOVA)结果显示,黄连木的遗传分化变异以群体内为主,占总变异量的94%,群体间的变异占6%.(5)UPGMA聚类、群体遗传结构分析和PCoA分析结果相一致,全部种质被划分为两大类,西南地区群体单独为一类,其他地区单独为一类.(6)利用7对SSR引物构建了210份黄连木种质的DNA分子身份证.

关键词

黄连木/SSR/遗传多样性/遗传分化/分子身份证

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2022
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.031
ISSN:1000-4025
被引量4
参考文献量19
段落导航相关论文