摘要
翻译延伸因子EF-1α(elongation factor 1 alpha)是细胞中最丰富的蛋白质之一,其在确保mRNA正确解码以产生细胞蛋白质方面发挥重要作用.该研究采用RT-PCR扩增方法克隆香菜CsEF-1α基因序列,利用生物信息学对CsEF-1α基因结构、序列特征及系统进化等进行分析,并采用qPCR探究CsEF-1α基因在香菜不同生长时期和非生物胁迫下的表达模式,为进一步揭示EF-1α基因调控机制的研究奠定基础.结果显示:(1)成功克隆获得香菜CsEF-1α基因序列;CsEF-1α基因包含1个1344 bp的开放阅读框,编码447个氨基酸,分子式为C2202H3544N594O644S20,蛋白质分子量为49.29 kD,等电点为9.12;氨基酸序列组成中赖氨酸数量最多(49个,占11.0％),色氨酸数量最少(3个,占0.7％);属碱性蛋白.(2)CsEF-1α蛋白主要由无规则卷曲(36.91％)和α-螺旋(30.43％)构成,定位于细胞质;系统进化树分析显示,CsEF-1α与胡萝卜、野生番茄、青蒿素和非洲菊的亲缘关系较接近;启动子分析包括4种植物生长发育元件、3种激素响应元件和3种胁迫响应元件.(3)qRT-PCR结果显示,CsEF-1α基因的表达量随着香菜生长发育时间的延长而升高,并且与转录丰度的变化一致;CsEF-1α基因对4种不同非生物胁迫的响应表达模式有所差异;随着胁迫时间的延长,在盐胁迫下CsEF-1α基因表现出先升高后降低趋势,而在低温、高温和干旱胁迫下表现出先降低再升高的趋势.研究表明,CsEF-1α基因参与了香菜对非生物胁迫的应答,在香菜生长发育和非生物胁迫中具有重要调控作用.
基金项目
新疆生产建设兵团重大科技项目(2016AA002-2)
塔里木大学校长基金(TDZKSS202245)
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