摘要
基于沙鞭的三代转录组数据,该研究利用PCR技术克隆DREB 基因,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR分析该基因的表达模式以及在20％PEG-6000模拟干旱胁迫处理下的表达特征,以探讨干旱胁迫下沙鞭DREB转录因子的功能和作用,为揭示PvDREB基因响应沙鞭的耐旱分子机制奠定基础.结果表明:(1)成功克隆获得一个沙鞭DREB基因,命名为Pv DREB;Pv DREB基因编码区长度831 bp、编码276个氨基酸,含有典型的AP2转录因子保守结构域;PvDREB蛋白是亲水性蛋白,不具有信号肽结构,存在跨膜结构和可能的糖基化及磷酸化位点.(2)系统进化分析显示,Poo DREB基因与毛竹的DREB 亲缘关系较近.(3)亚细胞定位预测表明,PvDREB蛋白定位于线粒体和细胞核中.(4)qRT-PCR显示,沙鞭根、茎和叶中PvDREB均可诱导表达但差异较大,且在茎中表达量最高,叶中次之,根中最低,具有明显的组织特异性;20％PEG-6000模拟干旱下,PvDREB基因在叶中的表达量随干旱胁迫时间增加而增加,12 h时达到最高,之后逐渐下降.研究推测,沙鞭PvDREB基因受干旱胁迫诱导表达,且该基因可能在沙鞭响应干旱胁迫的过程中起重要作用.
基金项目
国家自然科学基金(32160297)
国家自然科学基金(41761009)
青海省重点研发与转化计划国际合作专项(2023-HZ-810)
大学生创新创业训练计划(2022)(qhnucxcy2022055)
维普
万方数据