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沙鞭PvDREB基因克隆与表达特异性分析

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基于沙鞭的三代转录组数据,该研究利用PCR技术克隆DREB 基因,并对其进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR分析该基因的表达模式以及在20％PEG-6000模拟干旱胁迫处理下的表达特征,以探讨干旱胁迫下沙鞭DREB转录因子的功能和作用,为揭示PvDREB基因响应沙鞭的耐旱分子机制奠定基础.结果表明:(1)成功克隆获得一个沙鞭DREB基因,命名为Pv DREB;Pv DREB基因编码区长度831 bp、编码276个氨基酸,含有典型的AP2转录因子保守结构域;PvDREB蛋白是亲水性蛋白,不具有信号肽结构,存在跨膜结构和可能的糖基化及磷酸化位点.(2)系统进化分析显示,Poo DREB基因与毛竹的DREB 亲缘关系较近.(3)亚细胞定位预测表明,PvDREB蛋白定位于线粒体和细胞核中.(4)qRT-PCR显示,沙鞭根、茎和叶中PvDREB均可诱导表达但差异较大,且在茎中表达量最高,叶中次之,根中最低,具有明显的组织特异性;20％PEG-6000模拟干旱下,PvDREB基因在叶中的表达量随干旱胁迫时间增加而增加,12 h时达到最高,之后逐渐下降.研究推测,沙鞭PvDREB基因受干旱胁迫诱导表达,且该基因可能在沙鞭响应干旱胁迫的过程中起重要作用.
Cloning and Expression Characteristics of PvDREB Gene in Psammochloa villosa(Poaceae)

Psammochloa villosaDREB genegene cloningexpression characteristicsbioinformaticsdrought stress

张雨、苏旭、刘玉萍、苏丹丹、郑长远、陈金元

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青海师范大学生命科学学院,西宁810008

青海师范大学青海省青藏高原生物多样性形成机制与综合利用重点实验室,西宁 810008

高原科学与可持续发展研究院,西宁 810016

青海师范大学青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室,西宁810008

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沙鞭 DREB基因 基因克隆 表达特异性 生物信息学 干旱胁迫

国家自然科学基金国家自然科学基金青海省重点研发与转化计划国际合作专项大学生创新创业训练计划(2022)

32160297417610092023-HZ-810qhnucxcy2022055

2023

10.7606/j.issn.1000-4025.2023.02.0202

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2023.43(2)
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