摘要
为探究'凤丹'牡丹(Paeonia ostii 'Feng Dan')PoKAS 基因在脂肪酸合成中的功能,从转录组数据中获得3 个PoKAS 基因,克隆基因全长并进行生物信息学分析,通过qRT-PCR 检测它们在牡丹落花后第23、45、75、100和125 天时的表达.结果显示:(1)克隆得到的3 个基因序列全长分别为1 401、1 692 和1 215 bp,分别编码466、563 和404 aa;保守结构域分析发现,它们都含有KAS保守结构域,属于cond-enzymes 超蛋白家族.(2)系统进化树将三者分为三大类,表明其在进化上相对独立,分别命名为PoKASS Ⅰ、PoKAS Ⅱ和PoKASⅢ(GenBank登录号分别为OP056413、OP056412 和OP056414).(3)qRT-PCR分析发现,在牡丹落花后种子发育的5 个时期中,Po-KAS Ⅰ 和Po K AS Ⅱ基因在落花后75 d 和45 d时的表达量分别显著高于其他发育时期;PoKASⅢ基因在落花后45～125 d时的表达量均显著高于落花后23 d,说明PoKASⅢ基因在牡丹种子脂肪酸合成的整个过程中发挥着重要作用,而PoKASⅡ基因主要在种子油脂快速累积前期发挥作用.研究推测,该基因家族在'凤丹'牡丹种子脂肪酸形成过程中的不同发育时期发挥不同的作用.
基金项目
云南省重大基础专项生物资源数字化开发应用项目(202002AA10007)
云南省千人计划高层次人才专项(2019)()
云南省万人计划"云岭产业技术领军人才"专项(2018-212)
万方数据