摘要
该研究运用生物信息学方法鉴定甘蓝型油菜RPD3/HDA1 基因家族,检测了其在'黔油早 2 号'和'中双11'中的表达水平及 2 个品种在低温(4℃)和 ABA 胁迫下该家族基因的表达特征,以探讨RPD3/HDA1 基因在甘蓝型油菜中的潜在功能,为早熟油菜抗逆性遗传改良提供理论基础和候选基因.结果表明:(1)在甘蓝型油菜全基因组中共鉴定到 28 个RPD3/HDA1 基因,将其命名为BnHDA1～BnHDA28,聚类为 4 个亚家族,同一亚家族成员的基因结构较为相似;在该基因家族中共检测到 16 对复制基因,均为片段重复.(2)顺式作用元件预测统计中共发现 675 个元件与植物激素、环境胁迫和光响应有关.(3)qRT-PCR分析显示,RPD3/HDA1 基因在'黔油早2 号'中的表达量均高于'中双 11';低温胁迫下,'黔油早 2 号'和'中双 11'中RPD3/HDA1 基因呈差异表达,与'中双 11'相比,RPD3/HDA1 基因在'黔油早 2 号'中的下调幅度较大;ABA处理后,RPD3/HDA1 基因在 2 个品种中表达模式不一致,'黔油早 2 号'中大部分RPD3/HDA1 基因表达量较'中双 11'下调幅度小.研究认为,RPD3/HDA1 基因可能在油菜开花中发挥调节作用,而且可能通过激素信号通路和防御信号通路参与油菜的生长发育和防御反应的调节.
基金项目
早熟杂交油菜新品种黔油早2号中试与示范项目(黔科合成果[2020]1Y052)
贵州山区特色油料资源利用研究及实验平台建设项目(黔科中引地[2020]4012号)
贵州省油菜产业技术体系建设项目(GZCYTX2018-08)
油菜优质高产宜机收新品种选育项目(黔科合支撑[2022]重点031)
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