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皱边喉毛花及其近缘种叶绿体基因组结构与进化分析

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喉毛花属植物是藏茵陈入药基原植物之一,其属下物种关系一直存在争议.为建立稳定的喉毛花属下系统发育关系,本研究为重建喉毛花属下系统发育关系,通过对皱边喉毛花及其4个近缘种进行Illumina二代测序,共获得12个叶绿体基因组,并分析其结构特征与系统发育关系,为喉毛花属下物种分化研究提供可靠的分子依据.结果表明,(1)皱边喉毛花及其近缘种的叶绿体基因组均在150 kb左右,基因总数均为131个,其中编码基因81个,1R区核苷酸多态性较低,编码区比非编码区更保守;(2)除ndhB基因外,其余编码基因均受到纯化选择的作用,皱边喉毛花及其近缘种的密码子偏好性较弱;(3)基于蛋白编码序列(CDS)、第一、二位密码子位置(CDS1+2)、第三位密码子位置(CDS3)以及筛选出的高度变异基因间隔区(ndhC_trnV-UAC、psbC_trnS-UGA和psbK_psbI)序列等不同数据集构建的系统发育关系高度一致,皱边喉毛花、镰萼喉毛花及长梗喉毛花相互嵌套.总之,皱边喉毛花及其近缘种的叶绿体基因组相似度极高,物种之间存在相互嵌套的系统发育关系.研究可加深对喉毛花属系统发育关系的理解,为喉毛花属下物种分化研究提供可靠的分子依据.
Chloroplast Genome Structure and Evolution Analysis of Comastoma polycladum and Its Related Species

Comastomachloroplast genomecodon preferencepurifying selectionphylogeny

韩霜、余静雅、李孝平、牛玉、张发起

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中国科学院西北高原生物研究所高原生物适应与进化重点实验室,西宁 810001

中国科学院大学生命科学学院,北京 100039

喉毛花属 叶绿体基因组 密码子偏好性 纯化选择 系统发育

青海省科技国际合作专项青藏高原综合科学考察研究项目(第二次)

2021-HZ-8072019QZKK05020102

2023

10.7606/j.issn.1000-4025.2023.10.1629

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2023.43(10)
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