西北植物学报2023，Vol.43Issue(10) ：1640-1652.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2023.10.1640

文冠果XsSCL6基因克隆及表达分析

Cloning and Expression Analysis of XsSCL6 in Xanthoceras sorbifolium Bunge

赵雅欣 陈雨欣 卢涵冰 颜秉舟 敖妍
西北植物学报2023，Vol.43Issue(10) ：1640-1652.DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2023.10.1640
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文冠果XsSCL6基因克隆及表达分析

Cloning and Expression Analysis of XsSCL6 in Xanthoceras sorbifolium Bunge

赵雅欣 1陈雨欣 1卢涵冰 2颜秉舟 3敖妍1
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作者信息

  • 1. 北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室,北京 100083;国家能源非粮生物质原料研发中心,北京 100083
  • 2. 北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室,北京 100083
  • 3. 辽宁文冠实业开发有限公司,辽宁朝阳 122000
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摘要

GRAS家族HAM亚家族(scarccrow-like 6,SCL6)是一类植物特有的转录因子,在植物生长发育中具有关键作用,文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是国特有的重要林木能源植物,雄花的雌蕊败育是造成产量低的主要原因,为解析XsSCL6基因在文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)雌蕊发育中的调控作用,采用RT-PCR方法克隆文冠果4个XsSCL6同源基因,并对关键XsSCL6a蛋白进行亚细胞定位;对XsSCL6基因进行生物信息学分析,利用qRT-PCR分析XsSCL6基因在文冠果雌蕊败育过程中的表达模式.结果表明,(1)获得文冠果XsSCL6a、XsSCL6b、XsSCL6c和XsSCL 6d基因ORF全长,分别编码751,669,717,717个氨基酸,均属于亲水不稳定蛋白.(2)文冠果XsSCL6蛋白主要由无规则卷曲和a-螺旋构成,定位于细胞核.(3)XsSCL6a、XsSCL6c和XsSCL6d均包含GRAS保守结构域,文冠果XsSCL6蛋白和克莱门柚及甜橙的亲缘关系最近.(4)文冠果XsSCL6基因启动子中包含多种激素响应元件、植物发育相关元件.(5)qRT-PCR结果显示,XsSCL6基因各个时期在雄花中的表达量显著高于雌花,表达量的趋势和转录组FPKM值一致.(6)xso-miR171和XsSCL6基因均存在裂解方式的靶向关系,TPM值和FPKM值为负相关关系.XsSCL6基因可能受到xso-miR171调控,共同参与文冠果雌蕊发育过程,对文冠果花发育具有重要作用.

关键词

文冠果/XsSCL6/基因克隆/生物信息学/表达分析

Key words

Xanthoceras sorbifolium/XsSCL6/gene cloning/bioinformatics/expression analysis

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基金项目

国家自然科学基金(32071738)

国家重点研发计划(2022YFD2200400)

出版年

2023
西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
参考文献量12
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