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大叶杨干旱和水淹胁迫的转录组分析

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大叶杨(Populus lasiocarpa)是中国特有的杨属物种,干旱和水淹是影响大叶杨生长和分布范围的2个关键因子.AP2/ERF转录因子家族在植物响应非生物胁迫中发挥重要作用.研究采用转录组测序、生物信息学分析手段并结合分子实验验证初步鉴定了参与大叶杨干旱和水淹胁迫响应的关键基因.研究结果显示,(1)在大叶杨中分别鉴定到3 986/385个响应干旱/水淹胁迫的差异表达基因,其中包括237个同时响应干旱和水淹胁迫的差异表达基因.(2)在大叶杨中共鉴定到205个AP2/ERF家族成员,系统发育分析表明其在大叶杨中主要分为5个亚家族,并显著富集于差异表达基因中.(3)筛选部分胁迫前后差异表达的PlAP2/ERF基因进行qRT-PCR实验,经证实这些基因在大叶杨受到干旱/水淹胁迫时均可被诱导表达.综上,大叶杨在水淹胁迫下的差异表达基因数量明显少于干旱胁迫,AP2/ERF基因家族的部分基因参与到大叶杨干旱/水淹胁迫的应激表达过程.
Transcriptomic Analysis of Populus lasiocarpa in Response to Drought and Waterlogging Stress

Populus lasiocarpaAP2/ERFwaterlogging stressdrought stressdifferential expression

张佳琪、张新新、冯佳珺、施婷婷、张钰麟、王婧

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四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都 610000

大叶杨 AP2/ERF 水淹胁迫 干旱胁迫 差异表达

国家重点研发计划国家自然科学基金

2022YFD220120031971567

2023

10.7606/j.issn.1000-4025.2023.10.1653

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2023.43(10)
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