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基于RNA-Seq的向日葵脂肪酸合成基因筛选与分析

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为解析向日葵主要脂肪酸组分的生物合成分子机制,选用高油酸自交系J9、低油酸自交系P50为研究材料;进行错期播种同期采样试验,以液相色谱测定授粉后不同样品籽粒的脂肪酸组分与含量;利用RNA-Scq技术对不同样品测序,获得各样品与脂肪酸合成相关的基因表达数据,以气象学数据、液相色谱数据、向日葵基因组数据和转录组数据为基础,采用生物信息学方法分析相关数据.结果表明,(1)高油酸向日葵材料脂肪酸组分和含量受温度影响小,而低油酸材料易受温度影响;(2)J9和P50的12个样本的高表达基因数在7 500个左右,而中、低表达基因数相当,是高表达基因的2倍,约15 000个;(3)品种特异性表达基因和品种间特异表达基因去除重复后,在J9和P50在-CK和S数据集得到15 885个,GO功能富集获得的与脂质代谢直接相关的403个DEGs映射到与的脂质代谢相关的KEGG代谢通路,累计29个DEGs直接参与了 19条相关KEGG通路.
Screening and Analysis of Fatty Acid Synthesis Genes in Sunflower Based on RNA-Seq

sunflowerfatty acidRNA-Seqmolecular mechanism

郭树春、张艳芳、李素萍、邵盈、邢慧军、于海峰

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内蒙古自治区农牧业科学院作物科学研究所,呼和浩特 010031

内蒙古农业大学园艺与植物保护学院,呼和浩特 010010

四子王旗林业和草原局,内蒙古乌兰察布 011800

向日葵 脂肪酸 RNA-Scq 分子机制

国家自然科学基金现代农业产业技术体系建设项目内蒙古自治区科技计划内蒙古自治区党委组织部"西部之光"访问学者项目(2022)内蒙古自治区"揭榜挂帅"项目(2022)

32260514CARS-14-1-272021GG00142022JBGS0034

2023

10.7606/j.issn.1000-4025.2023.10.1663

西北植物学报
西北农林科技大学,陕西省植物学会

西北植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.031
ISSN：1000-4025
年,卷(期)：2023.43(10)
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