现代计算机2022，Vol.28Issue(18) ：9-15.DOI:10.3969/j.issn.1007-1423.2022.18.002

基于Transformer网络的抗癌肽的预测

Prediction of Anti-Cancer Peptides Based on Transformer Networks

蔡标 葛成 徐晴 陆翼 孔韧 常珊
现代计算机2022，Vol.28Issue(18) ：9-15.DOI:10.3969/j.issn.1007-1423.2022.18.002
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基于Transformer网络的抗癌肽的预测

Prediction of Anti-Cancer Peptides Based on Transformer Networks

蔡标 1葛成 1徐晴 1陆翼 1孔韧 1常珊1
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作者信息

  • 1. 江苏理工学院生物信息与医药工程研究所,常州 213001
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摘要

癌症是造成人类死亡的一个重要原因.抗癌肽(ACPs)是一系列由10～60个氨基酸组成的短肽,可以抑制肿瘤细胞的增殖或迁移,不易引起耐药性.将肽序列作为输入,搭建基于Transformer网络的抗癌肽模型并预测,模型自动将序列信息通过字符嵌入的方法映射为特征向量,实现了使用Transformer网络模型来自动识别抗癌肽和非抗癌肽.五倍交叉验证实验结果表明,该模型在数据集ACP240和ACP740上的准确率分别达到87.92％和83.75％.该模型能够有效地预测抗癌肽.

关键词

Transformer/抗癌肽/预测/肽序列

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基金项目

国家自然科学基金青年基金(81603152)

常州市科技支撑计划(社会发展)(CE20205033)

出版年

2022
现代计算机
中大控股

现代计算机

影响因子：0.292
ISSN：1007-1423
参考文献量4
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