现代计算机2024,Vol.30Issue(20) :8-13.DOI:10.3969/j.issn.1007-1423.2024.20.002

植物染色质可及性深度学习预测研究综述

A review of deep learning prediction of chromatin accessibility in plants

吴昭瑞 王舒宇 赵玉茗 于洋 魏金寒
现代计算机2024,Vol.30Issue(20) :8-13.DOI:10.3969/j.issn.1007-1423.2024.20.002

植物染色质可及性深度学习预测研究综述

A review of deep learning prediction of chromatin accessibility in plants

吴昭瑞 1王舒宇 1赵玉茗 1于洋 1魏金寒1
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作者信息

  • 1. 东北林业大学计算机与控制工程学院,哈尔滨 150000
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摘要

高通量测序技术的发展推动了染色质可及性检测方法的进步,但受限于湿实验的高成本、复杂性,以及植物细胞特性,植物染色质可及性研究相对滞后.研究人员尝试将植物染色质可及性与生物信息学方法相结合,来探讨生物信息学方法在染色质可及性数据和预测分析的优势和局限性.

Abstract

The development of high-throughput sequencing technology has promoted the progress of chromatin open region de-tection methods.However,the high cost and complexity of wet lab experimentation,along with the characteristics of plant cells,have led to the relative lag of plant chromatin accessibility research.Researchers have tried to combine plant chromatin accessibil-ity and bioinformatics methods.This paper discusses the application and advantages of bioinformatic methods in chromatin accessi-bility data and predictive analysis.

关键词

染色质可及性/深度学习/OCR分类预测

Key words

chromatin accessibility/deep learning/OCR classification prediction

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出版年

2024
现代计算机
中大控股

现代计算机

影响因子:0.292
ISSN:1007-1423
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