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布鲁氏菌Omp25蛋白抗原表位的生物信息学分析

Bioinformatic analysis of the epitope of Brucella Omp25 protein

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目的 利用生物信息学方法对羊布鲁氏茵Omp25蛋白进行分析,预测其T细胞以及B细胞的优势抗原表位.方法 从NCBI数据库中获取羊布鲁氏茵的Omp25蛋白的氨基酸序列.应用ProtParam在线软件分析Omp25蛋白的理化性质,应用SOMPA在线软件分析Omp25蛋白二级结构,应用Phyre2及SWISS-MODEL在线软件构建并分析Omp25蛋白三级结构,应用ABCpred和BepiPred等在线软件预测Omp25蛋白的B细胞抗原表位,应用SYFPEITHI和IEDB在线软件预测Omp25蛋白的T细胞抗原表位.结果 Omp25蛋白含有23个强碱性氨基酸,含有21个强酸性氨基酸,归类为亲水性稳定蛋白,Omp25蛋白的二级结构中α-螺旋占24.88％,β-折叠占25.35％,β-转角占2.82％,无规则卷曲占46.95％.联合不同软件的预测结果分析后,最终获得1段CD4+T细胞优势抗原表位、3段CD8+T细胞优势抗原表位以及3段B细胞优势抗原表位.结论 通过生物学信息的方法较为全面地预测了羊布鲁氏茵Omp25蛋白的优势T细胞以及B细胞抗原表位,为进一步研制羊布鲁氏茵表位疫苗构建提供了理论基础.

陈志强、沙桐、李智伟、丁剑冰、张峰波

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新疆医科大学基础医学院免疫学教研室,乌鲁木齐830011

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布鲁氏菌 Omp25 生物信息学 抗原表位

国家自然科学基金新疆维吾尔自治区自然科学基金新疆维吾尔自治区人民医院科技引进创新项目

81860375:2018D01C094:20180216

2020

新疆医科大学学报
新疆医科大学

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影响因子：0.76
ISSN：1009-5551
年,卷(期)：2020.43(4)
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