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肺栓塞患者中差异表达的长链非编码RNA的筛选及分析研究

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目的 筛选肺栓塞(pulmonary embolism,PE)患者中差异表达的长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA).方法 收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1月—2019年12月PE患者,4例为PE组,另取4例健康体检者为对照组.分别抽取两组外周静脉血5ml,测定血液中的In-cRNA表达,采用Illumina高通量测序技术及bcl2fastq软件测定血液中的IncRNA表达,采用limma包/DESeq包和StringTie软件/PrepDE.Py技术分析PE与健康人群外周静脉血中lncRNA的差异.结果 与对照组比较,PE组MERGE.25018.15,ERGE.30895.15,MERGE.32169.24,MERGE.30939.2,MERGE.22370.6,MERGE.32217.13,MERGE.9106.11,MERGE.7438.3,MERGE.30701.47,MERGE.6007.5升高;MERGE.27071.1,MERGE.14825.18,MERGE.30701.1,MERGE.20578.5;MERGE.32241.2;MERGE.15426.3;MERGE.10320.15;MERGE.2905.16,MERGE.22859.26,MERGE.28441.11降低,差异有统计学意义(P<0.05).差异倍数最大的上调lncRNA为MERGE.25018.15差异倍数最大的下调IncRNA为MERGE.27071.1.差异表达的lncRNA靶基因在GO生物学途径方面主要涉及呼吸系统的发育、血管内皮细胞迁移的正调节作用等.KEGG信号通路富集分析主要涉及VEGF信号通路、癌症中的胆碱代谢、HIF-1信号通路、MAPK信号通路、Wnt信号通路、mTOR信号通路、非小细胞肺癌相关信号通路.结论 PE患者在lncRNA中调控呼吸系统的发育、血管内皮细胞迁移的正调控、血管内皮的生成、低氧状态、恶性肿瘤等方面与健康人群存在差异.
Screening and analysis of differentially expressed long non-coding RNA in pa-tients with pulmonary embolism

曹嘉芮、曹国磊、李伟、何丽丽、牛海文、李晓晗、吐尔逊江·艾力、罗琴

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新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸神经内科,乌鲁木齐830011

肺栓塞 长链非编码RNA 基因芯片 生信分析

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2022

新疆医科大学学报
新疆医科大学

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CSTPCD
影响因子:0.76
ISSN:1009-5551
年,卷(期):2022.45(1)
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