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肛门失禁动物模型基因转录组学分析

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目的 通过转录组学测序技术(RNA-seq)分析手术离断括约肌致猪肛门失禁动物模型肛门括约肌的转录组学变化.方法 采用随机数字表法将8只成年长白猪分为空白组、肛门失禁动物模型组(模型组),每组4只.模型组予以手术离断括约肌致肛门括约肌损伤方式构建肛门失禁模型,空白组未手术.取各组肛门括约肌组织,提取肛门括约肌组织总RNA,采用RNA-seq技术进行转录组学测序,进行 GO(Gene oncology)和 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)生物信息学分析,并筛选差异基因.结果 测序结果表明,模型组与空白组差异基因共431个,其中上调基因280个,下调基因151个.转录组学测序分析发现模型组中蒙脱石基因(OBSCN)、趋化因子配体(CCL26)、Fyn-结合蛋白1(FYB1)及CXC基序趋化因子10(CXCL10)等基因表达上调,α-肌动蛋白-2(ACTG2)、人平滑肌肌球蛋白轻链激(MYLK)、鸡鸭甲状腺激素应答基因(THRSP)、活性物质2(ACTA2)等基因表达下调.GO分析发现,上调表达基因主要与免疫反应和趋化性等基因功能相关.KEGG分析发现,上调表达基因主要属于金黄色葡萄球菌感染、抗原处理和提呈相关基因等信号通路.结论 转录组学分析提示OBSCN等上调基因可能参与肛门失禁发生发展过程,这为研究肛门失禁致病机制研究提供实验依据.
Transcriptomic analysis of animal model of porcine anal incontinence

路明、刘扬、刘青、黄克林、洪文、杨博

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新疆医科大学第一附属医院肛肠科,乌鲁木齐830054

转录组学 动物模型 肛门失禁 细胞代谢

新疆维吾尔自治区天山创新团队项目

2020D14007

2022

10.3969/j.issn.1009-5551.2022.10.006

新疆医科大学学报
新疆医科大学

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CSTPCD
影响因子：0.76
ISSN：1009-5551
年,卷(期)：2022.45(10)
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