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结直肠癌miRNA相关的Ascl2靶基因中的预后标志物

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目的 探讨结直肠癌细胞中miRNA相关的Ascl2靶基因对结直肠癌患者的临床预后价值.方法 分析GEO数据库中干扰结肠癌LS174T细胞Ascl2表达的miRNA芯片数据(GSE34926)和基因RNA-Seq数据进行差异基因表达分析(GSE69036),通过对miRNA靶基因预测和差异基因表达对比,获得miRNA相关的Ascl2靶基因DEGs并行GO和KEGG分析,通过蛋白质互作网络图而筛选关键基因.用Kaplan-Meier方法进行生存分析.结果 干扰Ascl2的LS174T细胞内存在符合条件的350个miRNA及其4640靶基因(DEG1);干扰Ascl2的LS174T细胞内出现1582个差异表达基因(DEG2);交集的534个基因定义为miRNA相关的Ascl2靶基因;GO分析这些基因富集在蛋白结合和转录抑制,KEGG分析这些基因集中在代谢相关通路和癌症相关的miRNA等通路;PPI网络得到43个关键基因,其中4个关键基因COPS3、DYNLL2、RAB6A与COPG1与结直肠癌患者的生存有相关性,并且未见文献报道.结论 结直肠癌细胞Ascl2可通过miRNA调控具有不同的生物学功能的靶基因,其中COPS3、DYNLL2、RAB6A与COPG1可成为预测结直肠癌患者预后的新标志物.
Prognostic markers of miRNA-related Ascl2 target genes in colorectal cancer patients

武赟、胡文静、尚杨杨、汪荣泉

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400038重庆,陆军军医大学西南医院全军消化病研究所

结直肠癌 Ascl2 miRNA 总体生存率

国家自然科学基金

81572903

2021

10.3969/j.issn.1004-0188.2021.04.003

西南国防医药
成都军区医学科学技术委员会

西南国防医药

CSTPCD
影响因子：0.672
ISSN：1004-0188
年,卷(期)：2021.31(4)
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