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甘青青兰根际及内生细菌群落结构组成分析

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[目的]探究甘青青兰不同组织和根际土壤细菌群落结构组成及多样性.[方法]采用高通量测序技术对甘青青兰根、茎、叶和根际土壤细菌16SrRNA基因V5~V7区进行测序,并对甘青青兰不同组织和根际土壤细菌群落结构组成及多样性进行生物信息学分析.[结果]在甘青青兰不同组织和根际土壤中共获得2351个OTUs,归属29门、76纲、191目、319科和570属,且茎部(DtS)中内生细菌多样性指数最高,根部(DtR)中最低;甘青青兰不同组织和根际土壤中的优势菌门均是放线菌门和变形菌门;DtL和DtS中的优势细菌属均为芽孢杆菌和土壤红杆菌属,DtR中的优势菌属是土壤红杆菌属和游动放线菌,DtRS中的优势菌属为土壤红杆菌属和Gaiellla属;从整体结果来看,茎部(DtS)和叶部(DtL)内生细菌群落结构组成相似,而根部(DtR)和根际土壤(DtRS)中细菌群落结构组成相似.PICRUSt功能预测结果表明,甘青青兰不同组织和根际土壤细菌中富含与黄酮类、黄酮苷类和萜类等物质合成相关的功能基因.[结论]甘青青兰不同组织和根际土壤细菌具有丰富的群落和功能多样性,且部分优势细菌属具有潜在功能价值,为开发利用甘青青兰中有益微生物资源提供了理论参考.
Endophytic and rhizosphere bacterial community characteristics of Dracocephalum tanguticum

索朗桑姆、何萍、简阅、刘盼盼、徐雨婷、陈诚欣、禄亚洲、兰小中、张二豪

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西藏农牧学院食品科学学院,西藏林芝 860000

甘青青兰 不同组织 根际土壤 高通量测序 多样性 功能预测

西藏自治区自然科学基金西藏农牧学院生物技术一流专业建设项目

XZ202101ZR0117G2022-007

2023

西南农业学报
四川,云南,贵州,广西,西藏及重庆省(区,市)农科院

西南农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.679
ISSN:1001-4829
年,卷(期):2023.36(4)
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