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金鱼草TPS基因家族的全基因组鉴定和表达模式分析

Genome-wide identification and expression pattern analysis of terpenoid synthase(TPS)gene family in snapdragon(Antirrhinum majus L.)

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[目的]筛选、鉴定并分析金鱼草萜烯合酶(Terpenoid synthase,TPS)基因家族成员,确定金鱼草主要花香挥发性萜烯类物质合成的TPS基因,为进一步解析该基因功能奠定基础.[方法]基于生物信息学分析,鉴定AmTPS基因家族成员,并对其基因结构、蛋白保守基序、顺式作用元件、系统进化、染色体定位和共线性、蛋白质理化性质、亚细胞定位预测等进行分析;通过实时荧光定量(qRT-PCR)分析TPS候选基因在不同组织中的表达水平;最后利用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)对金鱼草花香挥发性成分进行分析鉴定.[结果]共鉴定出30个AmTPS候选基因,基因结构及保守基序显示AmTPS基因外显子数量为3~13个,保守基序DDxxD是主要基序,出现31次.AmnTPS启动子的顺式作用元件主要集中在生长与发育类元件中,抗逆、胁迫响应元件较少.系统发育分析显示,AmTPS共分为4个亚家族TPS-a,TPS-b,TPS-e/f,TPS-g,且TPS-a、TPS-g亚家族成员较多,TPS-e/f成员仅1个.蛋白理化性质结果表明,预测氨基酸数量(AA)为291~1124aa,分子量(MW)为34.392~131.778 KDa,理论等电点(pI)为4.98~6.98,疏水平均(GRAVY)值为-0.464~-0.24.qRT-PCR表达分析显示,AmTPS在花器官中的转录水平普遍高于其它部位,特别是TPS-g亚家族基因.利用GC-MS分析金鱼草花香成分,发现TPS-g亚家族基因合成的无环单萜类物质相对含量占比80.51%,与该家族基因表达模式吻合.[结论]金鱼草AmTPS基因家族成员在进化上比较保守,TPS-g亚家族的表达具有组织特异性,在金鱼草花香挥发性无环单萜的大量释放中发挥重要作用.本研究为进一步探究金鱼草萜烯类花香挥发性化合物提供参考.

石森堡、谯正林、王凤仪、胡慧贞、陈龙清

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西南林业大学园林园艺学院/云南省功能性花卉资源及产业化技术工程研究中心,昆明 650224

金鱼草 萜烯合酶 基因表达 花香成分

云南省基础研究专项重点项目云南省高层次人才引进计划高端外国专家专项西南林业大学科研启动项目云南省教育科学研究基因研究生项目

202001AS070039YNQR-GDWG-2018-01801102-1121092021Y252

2023

西南农业学报
四川,云南,贵州,广西,西藏及重庆省(区,市)农科院

西南农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.679
ISSN:1001-4829
年,卷(期):2023.36(5)
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