白腹锦鸡Chrysolophus amherstiae (Leadbeater)和红腹锦鸡Chrysolophus pictus (L.)是两个种还是两个亚种尚有争议.测定了白腹锦鸡C.amherstiae两个个体部分细胞色素b基因序列,得到完全相同的861bp的序列.与红腹锦鸡C.pictus的同源序列相比,在21个位点上出现变异,应用木村资生的双参数法算出两者的遗传距离为2.5%.根据鸡形目细胞色素b基因核苷酸替换的速率约为每百万年0 5%～ 0 7%,推断出两种锦鸡的分化时间至少为1 7百万年.从而在分子水平上支持白腹锦鸡(C.amherstiae)和红腹锦鸡(C.pictus)是两个独立种.
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