遗传2008,Vol.30Issue(5) :595-601.

人猿超科和旧大陆猴7种高等灵长类FKN全基因序列的测定及进化分析

Complete sequence determination and phylogenetic analysis of FKN among seven higher primates including homonids and Old World Monkeys

洪晓武 张亚平 储以微 高海峰 蒋正刚 熊思东
遗传2008,Vol.30Issue(5) :595-601.

人猿超科和旧大陆猴7种高等灵长类FKN全基因序列的测定及进化分析

Complete sequence determination and phylogenetic analysis of FKN among seven higher primates including homonids and Old World Monkeys

洪晓武 1张亚平 2储以微 1高海峰 1蒋正刚 1熊思东1
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作者信息

  • 1. 复旦大学上海医学院免疫学系,免疫生物学研究所,上海,200032
  • 2. 中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室,昆明,650223
  • 折叠

摘要

测定人猿超科(人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩和长臂猿)和旧大陆猴(猕猴和叶猴)7种高等灵长类FKN全基因序列,探讨其系统进化分析.用简并引物PCR(Degenerated PCR)法分别扩增FKN的3个外显子,其产物经琼脂糖凝胶回收、纯化后测序,然后用BioEdit软件剪切拼接FKN基因全序列,用DNAStar比对后比较基因和氨基酸序列同源性,Mega软件重构FKN基因进化树,应用Datamonkey分析FKN的负选择位点.序列分析发现人猿超科较旧大陆猴FKN基因除了有散在的点突变外,还有一明显的30 bp的核苷酸缺失突变;人FKN基因序列与黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴的同源性分别是99.2%、98.4%、98.1%、96.5%%、95.95和93.8%,由此推导的氨基酸序列同源性分别是98.5%、98.0%、97.7%、94.7%、93.7%和90.5%;FKN基因进化树表明人与黑猩猩关系更近,FKN基因进化和通常认为的物种进化一致;Datamonkey分析结果显示FKN存在3个负选择位点53Q.84D、239N.成功获得人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴7种高等灵长类物种FKN全基因序列,为后续探讨FKN在高等灵长类物种进化过程中免疫学功能演变及其结构与功能的关系奠定基础.

关键词

人猿超科/旧大陆猴/FKN/测序/进化分析

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基金项目

国家自然科学基金(30700737)

复旦大学校科研和教改项目(06J-1)

出版年

2008
遗传
中国遗传学会 中国科学院遗传与发育生物学研究所

遗传

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.082
ISSN:0253-9772
被引量2
参考文献量12
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