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茄科植物叶绿体基因组插入、缺失和核苷酸替代的发生方式及影响

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核苷酸替代和indels(插入、缺失统称)发生是进化的重要动力.以茄科植物为研究对象,探讨茄属中番茄和马铃薯、烟草属中绒毛状烟草和普通烟草分化时叶绿体基因组indels和核苷酸替代的发生方式,以及这两种突变对基因组造成的影响.结果显示:indels和核苷酸替代的发生都不是随意的.indels发生在A+T丰富的区域,1 bp indels占据总数的30%以上,大部分indels都为低于10 bp的较短片段.核苷酸替代表现出Ts(转换)/Tv(颠换)偏差,但T→G A→C颠换频率却明显增加.Ts/Tv比值出现种属特异性,番茄和马铃薯比较时替代的Ts/Tv比值低于绒毛状烟草和普通烟草比较时Ts/Tv比值.不同物种替代的(A+T)/(G+C)比值有一定差异,从而影响基因组的(G+C)%,此比值的差异与形成物种的生长习性有一定的关系.
The patterns and influences of insertions, deletionsand nucleotide substitutions in Solanaceae chloroplast genome

唐萍、王强、陈建群

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南京大学生命科学学院生物系,南京,210093

茄科植物 叶绿体 插入 缺失 核苷酸替代

国家自然科学基金

30570987

2008

遗传
中国遗传学会 中国科学院遗传与发育生物学研究所

遗传

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.082
ISSN:0253-9772
年,卷(期):2008.30(11)
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