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基因芯片筛选差异表达基因方法比较

Comparison of statistical methods for detecting differential expression in microarray data

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使用计算机模拟数据和真实的芯片数据,对8种筛选差异表达基因的方法进行了比较分析,旨在比较不同方法对基因芯片数据的筛选效果.模拟数据分析表明,所使用的8种方法对均匀分布的差异表达基因有很好的识别、检出作用.算法方面,SAM和Wilcoxon秩和检验方法较好;数据分布方面,正态分布的识别效果较好,卡方分布和指数分布的识别效果较差.杨树cDNA芯片分析表明,SAM、Samroc和回归模型方法相近,而Wilcoxon秩和检验方法与它们有较大差异.

单文娟、童春发、施季森

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南京林业大学国家林业局、江苏省林木遗传和基因工程重点实验室,南京,210037

基因芯片 杨树 差异表达

江苏省自然科学基金

BK2003213

2008

10.3724/SP.J.1005.2008.01640

遗传
中国遗传学会 中国科学院遗传与发育生物学研究所

遗传

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.082
ISSN：0253-9772
年,卷(期)：2008.30(12)
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