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大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析

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致病性大肠杆菌是引起动物泌尿系统感染的重要病原菌,本研究对泌尿生殖道感染出现潜血的大熊猫尿液中分离的一株致病性大肠杆菌(Escherichia coli CCHTP)进行全基因组测序,检测其中耐药基因和毒力因子的情况,同时对基因岛上耐药和毒力基因及其基因环境进行研究.研究发现,大肠杆菌CCHTP中存在多种类型的耐药基因,其中外排泵系统基因数量最多,包括mdfA、emrE和mdtN等介导多重耐药外排泵的基因.此外,该菌还携带166种毒力因子及563个相关毒力基因,其中属于黏附与侵袭类的毒力因子及相关基因数量最多.对19个基因岛分析发现,基因岛GIs011和GIs017中各有一段包含耐药和毒力基因的序列,两侧与可移动遗传元件(转座酶和插入序列)相连,这些结构可能介导耐药及毒力基因水平转移.本研究通过全基因组测序分析了大熊猫源致病性大肠杆菌中存在的耐药及毒力基因情况,对大熊猫相关疾病的科学治疗、合理用药有重要意义.
Whole genome sequencing reveals the distribution of resistance and virulence genes of pathogenic Escherichia coli CCHTP from giant panda

邓雯文、李才武、赵思越、李仁贵、何永果、吴代福、杨盛智、黄炎、张和民、邹立扣

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中国大熊猫保护研究中心,大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室,都江堰 611830

四川农业大学资源学院,成都 611130

大熊猫 大肠杆菌 全基因组测序 耐药基因 毒力因子

中国大熊猫保护研究中心项目国家自然科学基金

CCRCGP181918和31400066资助

2019

遗传
中国遗传学会 中国科学院遗传与发育生物学研究所

遗传

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.082
ISSN：0253-9772
年,卷(期)：2019.41(12)
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