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高通量测序技术分析壳寡糖对小鼠肠道菌群的影响

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  • 万方数据
目的 研究壳寡糖对小鼠肠道菌群的影响.方法 利用诺氟沙星灌胃建立肠道微生态失调小鼠模型,然后用壳寡糖对昆明小鼠每天进行灌胃,连续灌胃14d后,在无菌条件下采集各组小鼠盲肠内容物,提取基因组DNA,对样本的16S rDNA基因V3-V4区进行PCR扩增,采用Illumina-Miseq高通量测序平台测序,并对各样本进行生物信息学分析.结果 体外实验结果显示,壳寡糖能显著促进乳杆菌的生长,抑制大肠杆菌的生长,且呈浓度剂量依赖.OTUs结果显示,利用抗生素处理后,小鼠肠道菌群的数量与对照组相比明显减少,但壳寡糖能增加和恢复小鼠肠道内的菌群数量.肠道菌群Alpha多样性和Beta多样性分析结果显示,壳寡糖能增加小鼠肠道菌群的丰富度和多样性,可恢复抗生素对小鼠肠道菌群平衡造成的破坏.在属水平上对样品进行菌群种类和丰度分析的结果显示,4组样本在菌群种类和丰度上均存在较大的差异.Azospira、Bacteroides(拟杆菌属)、Lactobacillus(乳杆菌属)和Alistipes(另枝菌属)在4组样本中的菌属序列数目变化最为显著.其中壳寡糖组能够抑制有害菌Azospira的生长和繁殖,提高肠道益生菌群Bacteroides、Lactobacillus和Alistipes的种类和丰度,而自然恢复组与之相反.结论 壳寡糖能够提高小鼠肠道益生菌群的种类和丰度,可对抗生素造成的肠道菌群紊乱具有显著的改善和恢复作用.
EFFECT OF CHITOSAN OLIGOSACCHARIDE ON INTESTINAL FLORA IN MICE USING ILLUMINA-MISEQ HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING PLATFORM

赵丹莉、谢明杰

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辽宁师范大学生命科学学院,辽宁省生物技术与分子药物研发重点实验室,大连116081

壳寡糖 Illumina-Miseq高通量测序技术 小鼠肠道菌群

国家级大学生创新创业训练计划辽宁省自然科学基金

201710165126201602462

2018

营养学报
中国营养学会 军事医学科学院卫生学环境医学研究所

营养学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.654
ISSN：0512-7955
年,卷(期)：2018.40(5)
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