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基于高通量测序技术分析七种梨内生细菌多样性

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目前对于梨内生细菌多样性的研究几乎为零,这在很大程度上限制了梨内生细菌资源的开发和利用.为了探明梨内生细菌多样性,挖掘潜在的微生物资源及功能,研究采用高通量测序技术测定7个不同品种梨内生细菌菌群16S rRNA基因V4～V5区序列,并进行生物信息学分析.在7个不同品种梨中获得有效序列数为30001～42255条,并聚成33～99个可操作分类单元(OTU),涉及17个门、28个纲、52个目、85个科以及120个属.此外,7个梨品种内生细菌的Shannon指数、Simpson指数和Chao指数分别在0.481～1.154、0.452～0.730和42.333～103.875之间,说明测定的7个不同品种梨含有丰富的内生细菌种类,其中丰水梨和水晶梨内生细菌最为丰富.不同分类阶元的统计结果表明,不同品种的梨在门、纲、目、科、属水平上的主要内生细菌类型相同,但具体占比不同.7种梨内生细菌多样性均较为丰富,且不同梨品种菌群结构存在一定差异.研究为进一步揭示梨与内生细菌之间的互作关系提供参考,为后续研究奠定基础.
Analysis of endophytic bacterial diversity in seven pear varieties based on high-throughput sequencing

李秋桦、尹敏、裴妍、任禛、陈泽斌、夏体渊、胡靖祥、徐胜光、陈秀

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昆明学院 农学与生命科学学院,云南省高校生物炭工程研究中心,云南 昆明 650214

云南大学 医学院,云南 昆明 650091

不同品种梨 植物内生细菌 多样性 高通量测序法

云南省基础研究面上项目云南省地方本科高校基础研究联合专项资金面上项目云南省教育厅科学研究基金

202001BB0500692018FH001-0372020Y0471

2021

10.7540/j.ynu.20200114

云南大学学报(自然科学版)
云南大学

云南大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.663
ISSN：0258-7971
年,卷(期)：2021.43(3)
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