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内蒙古赤峰地区东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)冬季肠道微生物多样性研究

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基于16S rRNA基因测序技术对24份东北马鹿冬季粪便中细菌的结构和多样性进行分析,试图揭示东北马鹿冬季肠道微生态,为该物种保护提供新的见解.结果表明东北马鹿粪便样品中菌群分属于21门33纲74目131科306属,在门水平上,马鹿肠道菌群主要由厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidete)构成,相对丰度分别为79.43%和6.64%;在属水平上,马鹿肠道菌群主要由Ruminococcaceae_UCG-005和Christenseenel-laceae_R-7_group构成,相对丰度分别为21.51%和7.56%.以97%的序列一致性为划分标准进行聚类得到2220个OTUs,雄性样本中共有1873个OTUs,雌性样本中共有2143个OTUs,其中77个OTUs为雄性样本所特有,347个为雌性样本所特有.对比不同性别东北马鹿肠道菌群,通过LEfSe多级物种差异判别分析,丰度具有显著性差异的菌类包括:Sphingomonadales目、Kaistiaceae科、Sphingomonadaceae科、Muribaculaceae科、Xanthobacteraceae科、Defluviitaleaceae科、Kaistia属、Papillibacter属、Sphingomonas属、Alloprevotella属、GWE 2_31_10、Defluviitaleaceae_UCG_011、Eubacterium_rumi-nantium_group.
The Microbial Composition and Community Diversity of Red Deer(Cervus elaphus xanthopygus)in Winter in Chifeng Region of Inner Mongolia

郭金昊、袁子奥、张玮琪、张明海

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东北林业大学野生动物与自然保护地学院,哈尔滨, 150040

东北马鹿 冬季 肠道微生物 多样性

黑龙江省自然科学基金青年项目

QC2017011

2020

野生动物学报
东北林业大学 中国动物园协会

野生动物学报

北大核心
影响因子:0.271
ISSN:1000-0127
年,卷(期):2020.41(2)
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