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基于mtDNAD-loop区和Cyt b基因序列对鹅喉羚南疆亚种遗传多样性与系统进化地位的分析

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为进一步明确南疆地区鹅喉羚(Gazella subgutturosa)的遗传分化、遗传多样性水平和系统进化地位,以鹅喉羚南疆亚种(G.s.yarkandensis)为研究对象,运用PCR扩增和测序技术,研究mtDNA D-loop区和mtDNA Cyt b基因的序列特征,利用邻接法构建系统发育树和中介网络关系,以此阐明鹅喉羚南疆亚种的遗传多样性水平和系统进化地位.结果表明:鹅喉羚南疆亚种mtDNA D-loop区序列碱基A、T含量为60.38%,存在23个多态位点,占总位点数的2.90%,其中包括单一多态位点8个,简约性信息位点15个,存在6处插入和缺失,14个个体存在7个单倍型;平均单倍型多样度为0.813,核苷酸多样度为0.00890,平均核苷酸差异度为7.747.mtDNA Cyt b基因序列碱基A、T含量为58.39%,存在5个多态位点,占总位点数的0.46%,其中包括单一多态位点1个,简约性信息位点4个,14个个体存在4个单倍型;平均单倍型多样度为0.714,核苷酸多样度为0.00159,平均核苷酸差异度为1.725.以上数据表明鹅喉羚南疆亚种单倍型多样度远高于核苷酸多样度,具有非常丰富的遗传多样性.系统发育分析表明,鹅喉羚南疆亚种与其他亚种出现了明显的遗传分化,聚类于明显不同的进化支.网络关系分析表明,鹅喉羚具有明显的地理分布特征,研究涉及的鹅喉羚南疆亚种的单倍型大多聚于同一进化支,建议在南疆地区设立自然保护区,加强对鹅喉羚栖息地的生态保护,从而提高其生存适应性.
Genetic Diversity and Phylogenetic Status of Gazella subgutturosa yarkandensis Revealed by mtDNA D-loop and Cyt b Gene Analyses

张永浩、韦庆浩、郭丽君、阿布都热合曼·吐尔逊、王玉涛

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喀什大学生命与地理科学学院, 新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室, 喀什, 844000

鹅喉羚南疆亚种 mtDNAD-loop区 Cyt b基因 遗传多样性 系统进化地位

中国科学院西部之光人才培养计划喀什大学创新团队建设项目

2018-XBQNXZ-A1-002172602

2022

野生动物学报
东北林业大学 中国动物园协会

野生动物学报

北大核心
影响因子:0.271
ISSN:1000-0127
年,卷(期):2022.43(2)
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