医学信息学杂志2024,Vol.45Issue(2) :59-64.DOI:10.3969/j.issn.1673-6036.2024.02.010

3种主流现代解剖学本体的器官表征特点对比分析研究

A Comparative Study on the Organ Representation Characteristics of Three Mainstream Anatomical Ontologies

付璐 姚克宇 杨啸林 朱彦
医学信息学杂志2024,Vol.45Issue(2) :59-64.DOI:10.3969/j.issn.1673-6036.2024.02.010

3种主流现代解剖学本体的器官表征特点对比分析研究

A Comparative Study on the Organ Representation Characteristics of Three Mainstream Anatomical Ontologies

付璐 1姚克宇 2杨啸林 3朱彦2
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作者信息

  • 1. 中国中医科学院中国医史文献研究所 北京 100700
  • 2. 中国中医科学院中医药信息研究所 北京 100700
  • 3. 中国医学科学院/北京协和医学院基础医学研究所 北京 100005
  • 折叠

摘要

目的/意义 分析解剖学本体的器官表征特点,为其他领域本体的研究和构建提供参考.方法/过程 对比医学系统命名法——临床术语标准(SCT)、跨物种解剖本体Uberon、解剖学基础模型本体(FMA)3 种解剖学本体在器官分类方法、术语映射等方面的异同.结果/结论 SCT与Uberon主要依据器官功能分类,FMA主要依据器官解剖形态分类;FMA和Uberon中器官的概念与SCT中整体器官的概念相同,三者成对器官的表征形式较相近.

Abstract

Purpose/Significance To analyze the characteristics of organ representation of anatomical ontologies,and to provide ref-erences for the research and construction of ontology in other fields.Method/Process The similarities and differences of three mainstream anatomical ontologies of SNOMED CT(SCT),Uberon and the foundational model of anatomy ontology(FMA)in terms of organ classifi-cation methods and term mapping are compared.Result/Conclusion Among the three main types of anatomical ontologies,SCT and Uberon are mainly classified according to the function of organs,while FMA is mainly classified according to the anatomical morphology of organs.The concept of organs in FMA and Uberon is the same as the concept of entire organs in SCT,and the representation forms of paired organs in SCT,Uberon and FMA are similar.

关键词

医学系统命名法——临床术语标准/跨物种解剖本体/解剖学基础模型本体/器官表征

Key words

SNOMED CT(SCT)/Uberon/the foundational model of anatomy ontology(FMA)/organ representation

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基金项目

中国中医科学院科技创新工程项目(CI2021A05306)

中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(2021-I2M-1-057)

中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(ZZ13-YQ-126)

出版年

2024
医学信息学杂志
中国医学科学院

医学信息学杂志

CSTPCD
影响因子:1.348
ISSN:1673-6036
参考文献量13
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