医学信息(下旬刊)2011，Vol.24Issue(4) ：25-26.

神经胶质瘤疾病进程中的动态功能模块识别与分析

Identify dynamic modularity in protein interaction networks in Gliomas

邹义 宫滨生 张小宇 李冬果 高磊 李霞
医学信息(下旬刊)2011，Vol.24Issue(4) ：25-26.
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神经胶质瘤疾病进程中的动态功能模块识别与分析

Identify dynamic modularity in protein interaction networks in Gliomas

邹义 1宫滨生 2张小宇 2李冬果 1高磊 1李霞3
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作者信息

  • 1. 100069,首都医科大学生物医学工程学院
  • 2. 150000,哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院
  • 3. 100069,首都医科大学生物医学工程学院;150000,哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院
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摘要

目的:识别并分析神经胶质瘤疾病进程中的动态模块,找出在胶质瘤病程中发生变化的功能机制.方法:整合基因表达谱数据(GEO数据库中的GDS1962)与蛋白质互作网络信息(I2D),得到各疾病分期中的共表达互作网络,并采用MCL算法进行模块挖掘,对模块进行融合,并对动态模块进行功能注释.结果:找出了两个在胶质瘤疾病进程中涉及到互作关系以及互作强度发生显著变化的功能模块.结论:对模块中的节点(蛋白质)进行功能注释发现在胶质瘤的疾病进程中涉及到了金属离子转运、信号传导和DNA、RNA复制、修复等功能的改变.

关键词

胶质瘤/动态模块/共表达互作/功能改变

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出版年

2011
医学信息(下旬刊)
中华中药学会中医美容分会 陕西文博生物信息研究所

医学信息(下旬刊)

ISSN：1006-1959
参考文献量9
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