基于相似性度量的PPI网络链接预测算法相关性分析

Correlation Analysis of Link Prediction Algorithm of PPI Network Based on a Similarity Measurement

陈宇 ¹蔡荣彦²

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作者信息

1. 闽南师范大学数学与统计学院,福建漳州 363000;数据科学与统计重点实验室,福建漳州 363000;福建省粒计算及其应用重点实验室,福建漳州 363000;数字福建气象大数据研究所,福建漳州 363000
2. 国家电网福建省电力有限公司,福建福州 350003
折叠

摘要

针对基于相似性度量的蛋白质相互作用网络(PPI网络)链接预测算法Sim,证明Sim指标是基于3-跳路径的指标,分析Sim矩阵和PPI网络邻接矩阵具有较强相关性,为基于相似性度量的PPI网络链接预测算法提供理论依据.

Abstract

For the protein-protein interaction network(PPI network)link prediction algorithm Sim based on a similarity measurement,it is proved that the Sim index is based on a 3-hop path index.The analysis indicates that the Sim matrix and PPI network adjacency matrix have strong correlation,providing a theoretical basis for the PPI network link prediction algorithm based on similarity measurement.

关键词

PPI网络/链接预测/相似性度量/相关性分析

Key words

PPI network/link prediction/similarity measurement/correlation analysis

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基金项目

福建省教育厅中青年项目教师教育科研项目(JAT200297)

国家社会科学基金西部项目(23XTJ002)

福建省自然科学基金面上项目(2023J01910)

福建省自然科学基金面上项目(2023J01909)

出版年

2024

湖南理工学院学报(自然科学版)

湖南理工学院

湖南理工学院学报(自然科学版)

影响因子：0.259

ISSN：1672-5298

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