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定量稳定性同位素探针技术及其在微生物生态学研究中的应用

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定量稳定性同位素探针技术(qSIP)是将生态系统中微生物分类性状与代谢功能联系起来的有效工具,能够定量测定特定环境中单个微生物类群暴露于同位素示踪剂后微生物代谢活动或生长速率.qSIP技术采用定量PCR与高通量测序技术并结合稳定同位素探针技术(SIP),通过向环境样品添加标记底物进行培养,提取微生物生物标记物,利用超高速等密度梯度离心将被同位素标记的重链核酸与未被标记的轻链核酸进行分离,并对所有组分微生物类群进行绝对定量和测序分析,基于GC含量和未标记处理DNA密度曲线量化参与吸收转化的DNA同位素丰度.本文重点阐述qSIP的技术原理、数据分析流程及其在微生物生态学研究中的应用进展,并对该技术存在的问题进行了分析和展望.
Quantitative stable isotope probing technique and its applications in microbial ecology

邹文萱、沈菊培、张丽梅、胡盎、王建军、贺纪正

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中国科学院生态环境研究中心,北京100085

中国科学院大学,北京100049

湖南农业大学,长沙410128

中国科学院南京地理与湖泊研究所,南京210008

福建师范大学,福州350007

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同位素标记 微生物生长速率 高通量测序 微生物功能 微生物分类单元

2017YFE010980041930756

2021

10.13287/j.1001-9332.202107.032

应用生态学报
中国生态学学会 中国科学院沈阳应用生态研究所

应用生态学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：2.114
ISSN：1001-9332
年,卷(期)：2021.32(7)
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