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基于转录组分析重金属镉对长茎葡萄蕨藻的影响

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随着人类社会工业化进程的加快,重金属镉(Cd)污染对海洋生物的毒害作用突显.为了探索Cd胁迫下长茎葡萄蕨藻生理调控的分子响应机制,本文采用RNA-Seq技术对镉胁迫(Hcd2+)藻体组织转录组进行研究.结果 表明:与对照相比,Hcd>组共筛选出差异表达基因(DEGs) 702个,其中,257个基因上调表达,445个基因下调表达.对获得的DEGs进行功能注释及富集分析,发现长茎葡萄蕨藻的多种生物学功能受到Cd2+胁迫的影响,最终表现为抑制生长.GO富集分析发现,长茎葡萄蕨藻体内氧自由基的产生与清除出现失衡,并产生了DNA损伤等氧化伤害.KEGG富集分析发现,长茎葡萄蕨藻中多条与光合作用相关途径受到抑制,表明Cd2+胁迫导致长茎葡萄蕨藻的光合反应紊乱.
Effects of heavy metal cadmium on Caulerpa lentillifera based on transcriptome analysis

庞美霞、黄志立、刘小龙、唐勇军、李晓东、金刚

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深圳职业技术学院博士后创新基地,广东深圳518055

深圳职业技术学院应用化学与生物技术学院,广东深圳518055

长茎葡萄蕨藻 镉胁迫 分子机制 转录组

深圳职业技术学院博士后启动基金深圳市科技项目

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2021

应用生态学报
中国生态学学会 中国科学院沈阳应用生态研究所

应用生态学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:2.114
ISSN:1001-9332
年,卷(期):2021.32(12)
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