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越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究

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对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32％.SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70％),三核苷酸次之(21.45％).选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物.使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11 (VcSSR19),最小值为1.41 (VcSSR41),平均值为3.90.香农多样性指数变化范围是0.64 ～ 2.31,平均值为1.55.观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050 ～ 0.900和0.293 ～ 0.870,平均值分别为0.457和0.677.使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份.南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质.
SSR Mining and Polymorphism Analysis in Leaf Transcriptome of Blueberry

方茜、张园园、杨钰婷、黄苗苗、符巧丽、周慧莎、陈文荣、宗宇、郭卫东

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浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室,浙江师范大学化学与生命科学学院,浙江金华321004

越橘 转录组 SSR 亲缘关系 多态性

浙江省自然科学基金浙江省农业新品种选育重大科技专项浙江省“重中之重”学科生物学开放基金浙江师范大学博士基金科研项目

LQ16C1500012016C02052-9

2018

园艺学报
中国园艺学会 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

园艺学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.127
ISSN：0513-353X
年,卷(期)：2018.45(7)
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