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硫化氢控制鲜切苹果褐变的可变剪切基因分析

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利用RNA-seq测序技术分析了H2S处理和对照鲜切苹果两个贮藏时间点(0和6d)样品的可变剪切,从中挖掘与H2S控制鲜切苹果褐变相关的基因可变剪切.结果 表明,4组样品中基因可变剪切均以第1个外显子可变剪切(TSS)和最后1个外显子可变剪切(TTS)为主.与对照组同时期样品相比,H2S处理0和6d特有的可变剪切基因分别有921和2423个,GO分析结果表明两组样品的特有可变剪切基因主要富集在黄酮合成、细胞质、膜结构、水解酶、氧化还原酶活性等,KEGG富集分析表明上述基因主要富集在植物—病原菌相互作用、植物激素信号转导、碳水化合物代谢、氧化磷酸化、苯丙烷生物合成等代谢通路.此外,H2S处理抑制了多酚氧化酶(PPO)、过氧化物酶(POD)、脂氧合酶(LOX)和磷脂酶D (PLD)等基因的表达,同时提高了苯丙氨酸解氨酶(PAL)和NADH脱氢酶基因的表达.综上,H2S处理可能是通过改变过氧化物酶、苯丙烷代谢、膜结构以及能量代谢相关基因的可变剪切及表达模式,从而控制鲜切苹果褐变反应.
An Analysis of Alternative Splicing Events During Browning Inhibition of Fresh-cut Apples by Hydrogen Sulfide Treatment

陈晨、刘程惠、石立佳、姜爱丽、胡文忠

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大连民族大学生命科学学院,生物技术与资源利用教育部重点实验室,辽宁大连116600

苹果 鲜切 褐变 硫化氢 可变剪切

国家重点研发计划项目国家自然科学基金大连市青年科技之星项目

2016YFD0400903316015172017RQ147

2021

10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0847

园艺学报
中国园艺学会 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

园艺学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.127
ISSN：0513-353X
年,卷(期)：2021.48(11)
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