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睡莲WRKY家族的全基因组鉴定和分子进化分析

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在睡莲中共鉴定出69个NcWRKY转录因子,将其分成3个亚家族,即Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ,其中Ⅱ亚家族可进一步分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe,与拟南芥中WRKY亚家族分类相同.Ⅱc亚家族中含有17个成员,是睡莲WRKY家族中成员数最多的亚家族.所有成员的蛋白质二级结构中无规则卷曲所占比例高达为39％～78％.motif 1和motif 3被注释为WRKY保守结构.NcWRKY成员在睡莲14条染色体中均有分布,其中Ⅱa亚家族中所有成员都定位在Nc4号染色体.启动子顺式调控元件分析发现,NcWRKY成员广泛参与激素调控反应,通过不同组织中表达量分析筛选出在成熟叶柄中高表达的NcWRKY04与NcWRKY18,在花瓣中高表达的McpRKY05和在雄蕊中高表达的NcWRKY61.基因复制事件分析发现,NcWRKY家族主要以片段复制事件为主.基因表达网络关系分析预测NcWRKY61和NcWRKY63可能与其他成员有共表达关系.
Genomic Identification and Molecular Evolution of the WRKY Family in Nymphaea colorata

潘鑫峰、叶方婷、毛志君、李兆伟、范凯

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福建农林大学农学院,作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室,福州350002

睡莲 WRKY 全基因组鉴定 分子进化

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2022

10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0092

园艺学报
中国园艺学会 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

园艺学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.127
ISSN：0513-353X
年,卷(期)：2022.49(5)
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