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醋栗番茄染色体水平基因组组装

A Chromosome-level Genome Assembly of Solanum pimpinellifolium

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利用HiFi长片段测序技术对醋栗番茄PI365967的基因组进行测序和从头组装,共构建了 924个连续的重叠群序列,N50长度高达12.8 Mb,获得了 PI365967染色体水平长度为834 M的高质量基因组序列.与栽培番茄Heinz1706基因组进行比较分析发现,二者存在倒位、缺失等大量结构变异.GO富集分析揭示了发生结构变异的基因可能的生物学功能.

刘志强、蔡和序、崔霞

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中国农业科学院蔬菜花卉研究所,农业农村部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100081

中国农业大学园艺学院,北京100193

醋栗番茄 三代测序 基因组组装 结构变异

31930099

2022

10.16420/j.issn.0513-353x.2022-0578

园艺学报
中国园艺学会 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

园艺学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.127
ISSN：0513-353X
年,卷(期)：2022.49(10)
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