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基于SSR标记的42份樱花品种的聚类分析及DNA指纹图谱构建

Cluster Analysis and Construction of DNA Fingerprinting of 42 Oriental Cultivars of Flowering Cherry Based on SSR Markers

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通过14对SSR引物基于UPGMA法对42份樱花品种进行聚类分析,并采用引物和基因型组合法构建DNA指纹图谱.结果表明:14对SSR引物共检测出187个等位基因,每对引物平均13.36个,有效等位基因平均6.10个,观察杂合度平均0.31,期望杂合度平均0.80,Shannon's信息指数平均2.01,多态信息含量平均0.77;共检测出219个基因型,平均15.64个,平均区分率为22.11％.在Dice遗传相似系数约为0.18处时可分为3组,A组主要是山樱系、豆樱系和江户彼岸樱系的品种,B组是钟花樱系的品种,C组中只有尾叶樱;当Dice遗传相似系数约为0.37时,除八重红枝垂樱外,A组又可以分为6个小组.采用引物和基因型组合法构建了 42份樱花品种的DNA指纹图谱,为今后樱花品种资源的分子鉴定提供依据.

孙泽硕、蒋冬月、柳新红、沈鑫、李因刚、屈雨飞、李永华

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河南农业大学风景园林与艺术学院,郑州450002

浙江省林业科学研究院,杭州310023

浙江农林大学林业与生物技术学院,杭州310023

樱花 SSR 品种 聚类分析 DNA指纹图谱

国家自然科学基金青年基金浙江省公益技术研究计划

32101585LGN21C160001

2023

10.16420/j.issn.0513-353x.2021-1057

园艺学报
中国园艺学会 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

园艺学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.127
ISSN：0513-353X
年,卷(期)：2023.50(3)
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