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染色质免疫共沉淀测序技术及其在园艺植物中的应用研究进展

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近年来，基于染色质免疫共沉淀技术(ChIP)与第二代测序技术结合的染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)己被广泛用于研究DNA与蛋白质的相互作用，对解析园艺植物基因的表达与调控、靶基因筛选与定位、调控网络构建、染色质开放程度确认等方面具有较大的优势。本文综述了 ChIP-seq技术的发展简史及其在园艺植物转录因子和组蛋白修饰中所取得的进展，以期为园艺植物DNA—蛋白互作研究提供参考。
Advances in Chromatin Immunoprecipitation Sequencing and Its Application in Horticultural Plants
In recent years,chromatin immunoprecipitation sequencing technology(ChIP-seq)based on the combination of chromatin immunoprecipitation technology(ChIP)and second-generation sequencing technology has been widely used to study the interaction between DNA and proteins.It has great advantages in analyzing the expression and regulation of horticultural plant genes,screening and mapping of target genes,construction of regulatory networks,and confirmation of chromatin openness.This paper reviews the development history of ChIP-seq technology and its progress in the modification of transcription factors and histones in horticultural plants,with the aim of providing theoretical reference for the study of DNA-protein interactions in horticultural plants.

DNA and protein interactionchromatin immunoprecipitation sequencingtranscription factorhistone modification

翟挺楷、马湘玮、陈燕、张雪莹、李卓蕴、徐卢振、傅卓然、赖钟雄、林玉玲

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福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福州 350002

DNA与蛋白质互作 染色质免疫共沉淀测序 转录因子 组蛋白修饰

国家自然科学基金项目福建省自然科学基金项目福建省高原学科建设经费项目福建农林大学创新基金项目福建农林大学创新基金项目

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2024

10.16420/j.issn.0513-353x.2023-0125

园艺学报
中国园艺学会 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

园艺学报

CSTPCD北大核心
影响因子：1.127
ISSN：0513-353X
年,卷(期)：2024.51(1)
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